Studi in silico senyawa antikanker dalam ekstrak etanol 96% daun krisan (Chrysanthemum cinerariifolium (Trev)) terhadap reseptor human epidermal growth factor receptor-2 (3PP0)

INDONESIA:

Menurut data yang diterbitkan oleh World Health Organization (WHO) dari Global Burden of Cancer (GLOBOCAN), menyatakan bahwa jumlah kasus pengidap kanker mencapai 18,1 juta dan jumlah kematian pada 2018 mencapai 9,6 juta. Angka kejadian pasien pengidap kanker yang ada di Indonesia mencapai (136.2 dari 100.000 penduduk) dengan angka tersebut, kejadian kanker di Indonesia berada pada urutan ke-8 di Asia Tenggara. Salah satu agen terapi yang digunakan oleh pasien kanker payudara adalah penggunaan obat tucatinib, Namun, penggunaan tucatinib sebagai agen anti- Human Epidermal Growth Factor Receptor-2 (HER-2) memiliki profil keamanan yang kurang efektif dan berbahaya ketika mengkonsumsinya.Dalam hal ini daun tanaman krisan (Chrysanthemum cinerariifolium (Trev)) merupakan tanaman herbal yang diketahui secara empiris digunakan obat untuk berbagai jenis penyakit, salah satunya kanker. daun tanaman krisan memiliki senyawa bioaktif flavonoid yang menunjukkan aktivitas antikanker. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi aktivitas senyawa hasil skrining metabolit profiling UPLC-QTOF-MS/MS ekstrak etanol 96% pada daun tanaman Chrysanthemum cinerariifolium (Trev) oleh (Mutiah et al., 2020) terhadap reseptor Human Epidermal Growth Factor Receptor-2 (HER-2) serta memprediksi aktifitas biologis suatu senyawa dan profil farmakokinetikanya. Prediksi aktivitas senyawa dilakukan menggunakan aplikasi Molegro Virtual Docker. Seluruh reseptor yang digunakan dikatakan valid karena memiliki nilai RMSD <2 A dan didapatkan perbandingan hasil nilai rerank score pada native ligand dan senyawa pembanding tucatinib dengan hasil paling rendah yaitu -115.31 Kkal/mol pada senyawa Azoxystrobin serta memiliki persamaan interaksi asam amino. Selanjutnya dilakukan prediksi kadar aktifitas biologis senyawa menggunakan PASS online, didapatkan hasil senyawa kaempherol, isorhamnetin, Genistein, N-[(5-Chloro-1,2,3-thiadiazol-4-yl)methyl]-1-(2-isopropyl-4-methyl-1,3-thiazol-5-yl) Nmethylethanamine, memiliki aktivitas anti-neoplastic breast cancer yang tinggi dengan nilai Pa lebih dari 0,7 (Pa>0,7). Berdasarkan prediksi profil farmakokinetika menggunakan pkcsm tools, sebanyak 5 senyawa memiliki profil absorbsi yang baik, 4 senyawa dengan profil distribusi yang baik, Sedangkan untuk profil metabolisme dan ekskresi hampir keseluruhan memiliki profil yang baik.

ENGLISH:

Data published by the World Health Organization (WHO) from the Global Burden of Cancer (GLOBOCAN) states that the number of cases of people with cancer reached 18.1 million, and the number of deaths in 2018 reached 9.6 million. The incidence of cancer patients in Indonesia reaches (136.2 out of 100,000 populations). With this number, the incidence of cancer in Indonesia is ranked 8th in Southeast Asia. One of the therapeutic agents used by breast cancer patients is the use of the drug tucatinib. However, using tucatinib as an anti-Human Epidermal Growth Factor Receptor-2 (HER-2) agent has a safety profile that is less effective and dangerous when consuming it. In this case, the leaves of the chrysanthemum plant (Chrysanthemum cinerariifolium (Trev)) are a herbal plant empirically known to be used as medicine for various types of diseases, one of which is cancer. The chrysanthemum leaves have flavonoid bioactive compounds which exhibit anticancer activity. This research aims to predict the activity of the compounds of screening result from the UPLC-QTOF-MS/MS metabolite profiling of 96% ethanol extract on the leaves of the Chrysanthemum cinerariifolium (Trev) plant (Mutiah, et al., 2020) against the Human Epidermal Growth Factor Receptor-2 (HER-2) receptors and to predict the biological activity of a compound and its pharmacokinetic profile. Prediction of compound activity was carried out using the Molegro Virtual Docker application. All the receptors used are valid because they had a value of RMSD<2 A, and a comparison of the results of the rerank score values ​​for the native ligand. The comparator compound of tucatinib is obtained with the lowest result, i.e., -115.31 Kcal/mol for the Azoxystrobin compound, and also they have the same amino acid interactions. Furthermore, the prediction of compounds' biological activity levels using PASS online is carried out. The result shows kaempferol, isorhamnetin, Genistein, N-[(5-Chloro-1,2,3-thiadiazol-4-yl)methyl]-1-(2-isopropyl- 4-methyl-1,3-thiazol-5-yl) Nmethylethanamine, have high anti-neoplastic of breast cancer activity with Pa value of more than 0.7 (Pa>0.7). Based on the prediction of pharmacokinetic profiles using pkcsm tools, as many as 5 compounds have good absorption profiles, 4 compounds have good distribution profiles, and almost all of them have good profiles for metabolism and excretion.

ARABIC :

وفقا للبيانات التي نشرتها منظمة الصحة العالمية (WHO) للعبء العالمي للسرطان (GLOBOCAN)، تنص على أن عدد حالات المصابين بالسرطان بلغ ١٨.١ مليون وعدد الوفيات في عام ٢٠١٨ بلغ ٩.٦ مليون. يصل معدل الإصابة بالسرطان في إندونيسيا (١٣٦.٢ من أصل ١٠٠.٠٠٠ نسمة) مع هذا الرقم، فإن معدل الإصابة بالسرطان في إندونيسيا في المرتبة الثامنة في جنوب شرق آسيا. أحد العوامل العلاجية التي يستخدمها مرضى سرطان الثدي هو استخدام دواء التوكاتينيب، ومع ذلك، فإن استخدام التوكاتينيب كعامل مضادة لمستقبلة عامل نمو البشرة البشري -٢ (HER-2) له ملف أمان أقل فعالية وخطورة عند تناوله. في هذه الحالة، أوراق الأقحوان هي نباتات عشبية معروفة بأنها تستخدم تجريبيا كعلاج لأنواع مختلفة من الأمراض، أحدها السرطان. تحتوي أوراق الأقحوان على مركبات فلافونويد نشطة بيولوجيا تظهر نشاطا مضادة السرطان. يهدف هذا البحث إلى التنبؤ بنشاط المركبات الناتجة عن فحص تنميط المستقلبات UPLC-QTOF-MS/MS من مستخرجة الإيثانول ٩٦% لأوراق الأقحوان (مطيعة والأخرين، ٢٠٢٠) على مستقبل عامل نمو البشرة البشري -٢ (HER-2) والتنبؤ بالنشاط البيولوجي للمركبة وتنميطها الدوائي. تم التنبؤ بنشاط المركبة باستخدام تطبيق Molegro Virtual Docker. يقال إن جميع المستقبلات المستخدمة صالحة لأن لها قيمة RMSD تبلغ <2 A ومقارنة نتائج قيمة درجة إعادة الترتيب على مركبات مقارنة لربيطة أصلية و التوكاتينيب مع أدنى نتائج -١١٥.٣١ كيلو كالوري / مول في مركبة Azoxystrobin ولها معادلات تفاعل الأحماض الأمينية. علاوة على ذلك، فإن التنبؤ بمستوى النشاط البيولوجي للمركبة باستخدام PASS online حصل على نتائج مركبة كيمفيرول، إيزورامنيتين، جينيستين، ن- [(٥-كلورو-١،٢،٣-ثياديازول-٤-يل) ميثيل] -١- (٢-إيزوبروبيل-٤-ميثيل-١،٣-ثيازول-٥-يل) ن ميثيل ليتاناميني، له نشاط مرتفع في مضادة سرطان الثدي ومضادة الأورام بقيمة Pa تزيد عن ٠.٧ (Pa>0.7). استنادا إلى التنبؤ بتنميط الحرائك الدوائية باستخدام أداة pkcsm، فإن ما يصل إلى ٥ مركبات لها تنميط امتصاص جيد، و٤ مركبات لها توزيع جيد، بينما بنسبة التنميط الأيضية والإخراجية ، تتمتع جميعها تقريبا بتنميط جيد.