Studi in silico aktivitas anti aging ekstrak etanol 96% daun semanggi (Marsilea crenata C presl.) terhadap estrogen receptor alpha (2QA8)

ABSTRAK

Ilmu pengetahuan telah menemukan cara untuk mencegah penuaan kulit pada wanita menopause. Salah satu terapinya adalah terapi sulih estrogen (17β-estradiol). Penuaan kulit pada wanita menopause dikaitkan dengan penurunan ekspresi ERα. Fitoestrogen telah mendapatkan perhatian sebagai antiaging karena efek sampingnya yang lebih sedikit. Tujuan dilakukan penelitian ini adalah untuk memprediksi efek anti aging senyawa ekstrak etanol 96% Marsilea crenata melalui jalur aktivasi ERα (ID 2QA8). Senyawa hasil metabolite profiling UPLQ-QToF MS/MS ekstrak etanol 96% Marsilea crenata dilakukan analisis sifat fisikokimia menggunakan SwissADME dan toksisitas menggunakan ProTox II online tool. Analisis ini dilakukan sebagai seleksi awal keamanan senyawa untuk terapi. Hasil seleksi 31 senyawa dipreparasi menggunakan aplikasi ChemDraw 12.0. Optimasi geometri dilakukan dengan menggunakan aplikasi Avogadro 1.2.0, kemudian dilakukan molecular docking dengan aplikasi PyRx 0.8 dengan metode Autodock vina. Visualisasi hasil docking dilakukan menggunakan aplikasi Biovia Discovery Studio 2021 untuk mencari interaksi agonis terhadap ERα. Nilai RMSD ≤ 2Å menandakan penambatan valid dan aplikasi dapat digunakan. Hasil studi in silico menunjukkan dari 43 senyawa hasil metabolite profiling terdapat 2 senyawa yang bersifat agonis terhadap ERα. Senyawa tersebut memiliki sifat fisikokimia sesuai standar lipinski sehingga dapat berikatan dengan ERα. Persen area 2 senyawa tersebut kecil sehingga tidak dapat dijadikan dasar utama efek anti penuaan dari Marsilea crenata .

ABSTRACT

Science has found a way to prevent skin aging in postmenopausal women. One of the therapies is estrogen replacement therapy (17β-estradiol). Skin aging in postmenopausal women is associated with decreased ERα expression. Phytoestrogens have received attention as antiaging because of their fewer side effects. The purpose of this study was to predict the anti-aging effect of the 96% ethanol extract of Marsilea crenata through the ERα activation pathway (ID 2QA8). The metabolite profiling compound UPLQ-QToF MS/MS 96% ethanol extract of Marsilea crenata was analyzed for physicochemical properties using SwissADME and toxicity using ProTox II online tool. This analysis was carried out as an initial selection of the safety of compounds for therapy. The results of the selection of 31 compounds were prepared using the ChemDraw 12.0 application. Geometry optimization was carried out using the Avogadro 1.2.0 application, then molecular docking was carried out with the PyRx 0.8 application using the Autodock vina method. Visualization of docking results was carried out using the Biovia Discovery Studio 2021 application to look for agonist interactions with ERα. RMSD value 2Å indicates valid tethering and application can be used. The results of the in silico study showed that of the 43 compounds resulting from the metabolite profiling, there were 2 compounds that were agonists against ERα. These compounds have physicochemical properties according to Lipinski standards so that they can bind to ERα. The percentage area of these 2 compounds is small so they cannot be used as the main basis for the anti-aging effect of Marsilea crenata.

ملخص البحث

لقد وجد العلم طريقة لمضاد لشيخوخة الجلد عند النساء بعد انقطاع الطمث. منها العلاجات ببدائل الإستروجين. تكون شيخوخة الجلدة عند النساء بعد انقطاع الطمث بانخفاض تعبير ERα. كان فيتويستروغنز الاهتمام كمضاد للشيخوخة بسبب أقل آثارها الجانبية. كان الغرض من هذه الدراسة هو التنبؤ بالتأثير المضاد للشيخوخة لمستخلص الإيثانول بنسبة 96 ٪ من Marsilea crenata خلال مسار تنشيط ERα (ID 2QA8). تم تحليل مركب التنميط المستقلب UPLQ-QToF MS / MS 96٪ من مستخلص الإيثانول من Marsilea crenata من أجل الخصائص الفيزيائية والكيميائية باستخدام SwissADME والسمية باستخدام أداة ProTox II عبر الإنترنت. تم إجراء هذا التحليل كاختيار الأول لسلامة المركبات للعلاج. تم تحضير نتائج اختيار 31 مركبًا باستخدام تطبيق ChemDraw 12.0. تم إجراء تحسين الهندسة باستخدام تطبيق Avogadro 1.2.0، ثم تم تنفيذ الإرساء الجزيئي باستخدام تطبيق PyRx 0.8 باستخدام طريقة Autodock vina. تم إجراء تصور لنتائج الإرساء باستخدام تطبيق Biovia Discovery Studio 2021 للبحث عن تفاعلات ناهضة مع ERα. تشير قيمة RMSD 2Å إلى ربط صالح ويمكن استخدام التطبيق. أظهرت نتائج دراسة السيليكو أنه من بين 43 مركبًا ناتجًا عن التنميط المستقلب ، كانا مركبان منبهتان مع ERα. تتمتع هذه المركبة بخصائص فيزيائية كيميائية وفقًا لمعايير ليبينسكي بحيث يمكنها الارتباط بـ ERα. النسبة المئوية لهذين المركبين صغيرة حتى لا يمكن استخدامها كأساس رئيسي للتأثير في مضاد للشيخوخة لـ Marsilea crenata.