[17620053 not for publication] Variabilitas klon mangga madu (Mangifera indica L. cv. Madu) berdasarkan karakter morfologi dan marka molekuler ISSR (Inter-Simple Sequences Repeat)

ABSTRAK

Mangga madu merupakan salah satu klon mangga budidaya di Kebun Percobaan Cukurgondang, Pasuruan yang dikoleksi dari beberapa wilayah di Indonesia. Namun, beberapa mangga madu yang ada belum terkarakterisasi dengan baik. Karakterisasi mangga yang tepat berguna dalam pengelolaan sumber daya genetik dan proses sertifikasi. Mangga madu yang bermutu bisa didapatkan melalui tahapan sertifikasi, sehingga dapat memberikan jaminan kepada konsumen. Karakterisasi mangga madu dapat dilakukan berdasarkan karakter morfologi maupun molekuler. Karakter morfologi yang diamati pada penelitian ini hanya terbatas pada morfologi pohon dan buah, sehingga perlu dilakukan karkterisasi molekuler. Salah satu marka molekuler yang digunakan dalam karakterisasi mangga adalah Inter-Simple Sequences Repeat (ISSR). Teknik ISSR pada penelitian ini menggunakan lima primer, yang terdiri dari ISSR-835, ISSR-843, ISSR-848, ISSR-855, ISSR-5. Mangga madu yang diamati sebanyak 8 klon, sedangkan 3 klon mangga kuweni digunakan sebagai out-group. Kedua karakterisasi dilakukan untuk mengetahui nilai similaritas, pengelompokan dan variasi genetik dari 11 aksesi yang diamati. Hasil skoring morfologi dari 8 klon mangga madu menunjukkan 11 karakter beragam dan 9 karakter seragam yang terbagi dalam 4 kelompok. Karakterisasi molekuler ISSR pada Mangga Madu menghasilkan 4 kelompok dengan anggota kelompok yang berbeda dari pengelompokan berdasarkan karakter morfologi. Variasi genetik 11 aksesi mangga pada karakter morfologi tergolong rendah, sedangkan cenderung tinggi pada karakter molekuler ISSR. Hasil amplifikasi DNA menggunakan kelima primer menunjukkan bahwa primer ISSR-835, ISSR-848, dan ISSR-855 dapat menghasilkan pita polimorfik hingga 100%.

ABSTRACT

The madu mango is one of the mango clones cultivated at the Cukurgondang Experimental Garden, Pasuruan that has been collected from multiple regions in Indonesia. There are some existing madu mango varieties that have not been well characterized. Mango characterization is helpful in the management of genetic resources and in the certification process. Through the certification process, consumers can be guaranteed that madu mango is of high quality. Madu mango can be classified according to morphological and molecular characteristics. The morphological characters observed in this study were only limited to vegetative morphology, so it was necessary to carry out molecular characterization. One of the molecular markers used in mango characterization is Inter-Simple Sequences Repeat (ISSR). The ISSR technique in this study used five primers, consisting of ISSR-835, ISSR-843, ISSR-848, ISSR-855, ISSR-5. There were 8 madu mango clones observed, while 3 kuweni mango clones were used as an out-group. Both characterizations were carried out to determine the value of similarity, grouping and genetic variation of the 11 accessions observed. The morphological scoring of 8 madu mango clones revealed 11 different characteristics and nine identical characteristics that were divided into 4 groups. The molecular characterization of ISSR on madu mango resulted in 4 groups with different group members from the grouping based on morphological characters. The genetic variation among 11 mango accessions was low on morphological characters, but relatively high on the molecular character ISSR. According to the DNA amplification results using the five primers, the ISSR-835, ISSR-848, and ISSR-855 primers are able to produce polymorphic bands up to 100%.

مستخلص البحث

يعتبر مانجو مادو أحدًا من استنساخات المانجو المزروع في الحديقة التجريبية Cukurgondang، باسوروان، والتي يجمعها من بعض المناطق في إندونيسيا. لكن بعض من مانجو مادو الموجود لم يميزها جيدًا. يعتبر التوصيف الصحيح للمانجو مفيدًا في عملية المورد الوراثي وعملية التصديق. مانجو مادو الجيد يحصل من مرحلة التصديق، بحيث يمكن أن يوفر الضمان للمستهلكين. وصف مانجو مادو بناءً على الصفات المورفولوجية والجزيئية. اقتصرت الصفات المورفولوجية الملاحظة لهذا البحث على المورفولوجية النباتية فقط، لذلك لازم أن يقام بالتوصيف الجزيئي. واحدة من العلامات الجزيئية المستخدمة في توصيف المانجو هي Inter-Simple Sequences Repeat (ISSR). استخدمت تقنية ISSR في هذا البحث خمس أساسيات، تتكون من ISSR - 835 و ISSR - 843 و ISSR - 848 و ISSR - 855 و ISSR - 5. مانجو مادو الملاحظ يبلغ 8 استنساخات، وأما استخدم 3 استنساخات من المانجو كوويني كمجموعة خارجية. يتم كلا التوصيفين لمعرفة قيمة التشابه والتجميع والتنوع الوراثي من إحدى عشر مجتمعًا الملاحظة. أظهرت نتائج التقييم المورفولوجي لـ 8 استنساخات من مانجو مادو 11 صفة متنوعة و 9 صفات موحدة التي تنقسم إلى 4 مجموعات. يحصل التوصيف الجزيئي ISSR لـ مانجو مادو على 4 مجموعات مع أعضاء المجموعة مختلفين بناءً على الصفات المورفولوجية. كان التنوع الوراثي لـ 11 مجتمعًا من المانجو في الصفات المورفولوجية النباتية منخفضًا، أما كان يميل إلى أن يكون مرتفعًا في الصفات الجزيئية لـ ISSR. أظهرت نتائج DNA amplification باستخدام خمسة أساسيات على أن أساسي ISSR - 835 و ISSR – 848 و ISSR - 855 يؤنتج الشريط المتعدد الأشكال إلى حدّ 100٪.