Pengelompokan klon mangga golek (Mangifera indica L. cv. Golek) berdasarkan karakter morfologi dan marka molekuler ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat)

ABSTRAK

Mangga golek merupakan salah satu varietas mangga yang berasal dari Indonesia. Mangga golek dibudidayakan di Kebun Percobaan Cukurogondang, Pasuruan sebanyak 9 klon mangga dari daerah yang berbeda-beda. Namun, sampai saat ini baru satu dari delapan klon mangga golek yang telah tersertifikasi oleh Kementrian Pertanian. Sertifikasi ini menjadi jaminan bahwa varietas yang beredar memiliki keunggulan dan tidak merugikan bagi masyarakat dan lingkungan. Salah satu syarat untuk mendapat sertifikasi tersebut yaitu perlu dilakukannya karakterisasi pada klon mangga golek. Karakterisasi dilakukan berdasarkan karakter morfologi dan marka molekuler. Karakterisasi morfologi diamati secara langsung hanya pada organ vegetatif yang berdasarkan panduan dari Descriptors for mango (Mangifera indica L.). Marka molekuler yang digunakan adalah ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) dengan empat macam primer yaitu ISSR-835, ISSR-843, ISSR-848, ISSR-855. Data karakterisai morfologi dan molekuler yang berupa skoring dianalisis menggunakan program PAST (Paleontological Statistics) untuk mengetahui pengelompokan, nilai koefisien similaritas dan keragaman, sedangkan untuk mengetahui primer terbaik dianalisis menggunakan program Microsoft Excel. Sebanyak 9 klon mangga golek memiliki karakter morfologi yang beragam dan karakter yang seragam. Analisis pengelompokan berdasarkan karakter morfologi menunjukkan bahwa 9 klon mangga golek mengelompok menjadi 3 grup. Analisis pengelompokan berdasarkan marka molekuler ISSR pada mangga golek menghasilkan 4 grup dan memiliki anggota grup yang berbeda dari pengelompokan berdasarkan karakter morfologi. Hasil amplifikasi DNA menggunakan keempat primer menunjukkan bahwa primer ISSR-835 dan ISSR-843 mampu menghasilkan pita DNA polimorfik dengan presentase 100%, namun sampel yang teramplifikasi dengan baik pada primer ISSR-835.

ABSTRACT

Mango golek is one of the mango varieties originating from Indonesia. Mango golek is cultivated at the Cukurogondang Experimental Garden, Pasuruan as many as ninth mango clones from different areas. However, until now only one of eight mango golek clones has been certified by the Ministry of Agriculture. This certification is a guarantee that the varieties in circulation have advantages and are not detrimental to society and the environment. One of the requirements for obtaining the certification is the need to characterize the mango golek clone. Characterization was carried out based on morphological characters and molecular markers. Morphological characterization was observed directly only in vegetative organs based on the guidelines from Descriptors for mango (Mangifera indica L.). The molecular marker used is ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) with four types of primers, namely ISSR-835, ISSR-843, ISSR-848, ISSR-855. Morphological and molecular characterization data in the form of scoring were analyzed using the PAST (Paleontological Statistics) program to determine grouping, similarity, and diversity coefficient values, while determining the best primers were analyzed using the Microsoft Excel program. A total of 9 mango golek clones had diverse morphological characters and uniform characters. Grouping analysis based on morphological characters showed that 9 mango golek clones were grouped into 3 groups. Grouping analysis based on ISSR molecular markers on mango golek resulted in 4 groups and had different group members from the grouping based on morphological characters. The results of DNA amplification using the four primers showed that the ISSR-835 and ISSR-843 primers were able to produce polymorphic DNA bands with a percentage of 100%, but the samples were well amplified on the ISSR-835 primer.

مستخلص البحث

مانجو جوليك هو أحد أصناف المانجو التي نشأت في إندونيسيا. يُزرع مانجو جوليك في حديقة التجريبية جوكوروغوندانغ ، فاسوروان ما يصل إلى ٩ استنساخ للمانجو من مناطق مختلفة. ومع ذلك ، حتى الآن تم اعتماد واحدة فقط من ثمانية أنواع من المانجو غوليك من قبل وزارة الزراعة. هذه الشهادة هي ضمان أن الأصناف المتداولة لها مزايا وليست ضارة بالمجتمع والبيئة. أحد متطلبات الحصول على الشهادة هو الحاجة إلى توصيف استنساخ مانجو جوليك. تم إجراء التوصيف بناءً على الخصائص المورفولوجية والعلامات الجزيئية. لوحظ التوصيف المورفولوجي مباشرة فقط في الأعضاء الخضرية بناءً على Descriptors for mango (Mangifera indica L.) . العلامة الجزيئية المستخدمة هي ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) مع أربعة أنواع من البادئات ، وهي ISSR-835 و ISSR-843 و ISSR-848 و ISSR-855. تم تحليل بيانات التوصيف المورفولوجي والجزيئي في شكل نقاط باستخدام برنامج PAST (Paleontological Statistics) لتحديد قيم معامل التجميع والتشابه والتنوع ، بينما تم تحليل أفضل بادئات باستخدام برنامج Microsoft Excel. مجموعه ٩ من استنساخ مانجو جوليك لها سمات مورفولوجية متنوعة وشخصيات موحدة. أظهر تحليل التجميع بناءً على الصفات المورفولوجية أن ٩ مستنسخات من مانجو غوليك تم تجميعها في ٣ مجموعات. نتج عن تحليل التجميع بناءً على الواسمات الجزيئية ISSR على مانجو جوليك ٤ مجموعات وكان لها أعضاء مختلفون من المجموعة بناءً على الصفات المورفولوجية. أظهرت نتائج تضخيم الحمض النووي باستخدام البادئات الأربعة أن البادئات ISSR-835 و ISSR-843 كانت قادرة على إنتاج نطاقات DNA متعددة الأشكال بنسبة ١۰۰ % ، ولكن تم تضخيم العينات جيدًا على ISSR-835 التمهيدي.