[Tidak dipublish] Studi In Silico potensi antivirus SARS-Cov-2 senyawa Karvakrol dan Timol terhadap reseptor Nucleocapsid Phosphoprotein dan reseptor NSP 3

INDONESIA:

Akhir Desember 2019 di Wuhan, China telah muncul penyakit kasus baru yang bernama COVID-19 yang diperantarai oleh virus SARS-Cov-2. Beberapa penelitian telah dilakukan pada obat yang diharapkan dapat menyembuhkan COVID-19. Hingga saat ini masih terus dilakukan penelitian untuk menemukan obat yang secara spesifik memiliki aktivitas antivirus SARS-Cov-2. SARS-Cov-2 tersusun dari protein struktural dan non�struktural. Nucleocapsid merupakan protein struktural, sedangkan Non Structural Protease�3 (Nsp-3) merupakan protein non-struktural. Kedua protein tersebut bertanggung jawab pada replikasi dan transkripsi virus. Senyawa karvakrol dan timol terbukti memiliki aktivitas antivirus yaitu dapat menghambat replikasi dan transkripsi virus RNA. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi toksisitas dan memprediksi aktivitas antivirus senyawa karvakrol dan timol terhadap kedua reseptor. Prediksi toksisitas dilakukan menggunakan aplikasi Protox II Online Tools. Hasil nilai LD50 dan kelas toksisitas digolongkan menurut Globally Harmonized System. Senyawa karvakrol memiliki nilai LD50 sebesar 810mg/kg dan timol sebesar 640mg/kg. Keduanya termasuk dalam kelas toksisitas ke 4. Prediksi aktivitas antivirus senyawa dilakukan menggunakan aplikasi Molegro Virtual docker(MVD). Nilai yang digunakan untuk mengukur ikatan ligan-reseptor adalah rerank score. Reseptor nukleokapsid (PDB ID:6VYO) dan NSP-3 (PDB ID:6YWL) dikatakan valid, sebab mempunyai nilai RMSD <2 Å. Hasil penelitain menunjukkan bahwa kedua senyawa memiliki potensi aktivitas antivirus yang lebih baik pada reseptor nukleokapsid (PDB ID:6VYO) daripada NSP-3 (PDB ID:6YWL).