Ilmi, Zahrobatul Lil (2021) Keragaman kultivar Pisang Kepok (Musa acuminata x Musa balbisiana (ABB) cv. Kepok) di Kabupaten Malang berdasarkan karakter morfologi dan molekuler RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
|
Text (Fulltext)
17620017.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (3MB) | Preview |
Abstract
INDONESIA:
Jawa Timur merupakan wilayah produksi pisang tertinggi di Indonesia dimana Kabupaten Malang sebagai pemasok terbesar. Salah satu kultivar pisang yang dibudidayakan di Kabupaten Malang adalah pisang kepok. Kondisi geografis Kabupaten Malang dengan ketinggian dan jenis tanah yang berbeda dimungkinkan dapat mempengaruhi keragaman pisang kepok. Penamaan pisang kepok di Kabupaten Malang bervariasi sehingga pisang kepok perlu diidentifikasi untuk mengetahui kesamaan dan perbedaan genetik. Terlebih lagi keragaman genetik pisang kepok di Kabupaten Malang belum dianalisis dengan baik sehingga dibutuhkan analisis keragaman genetik demi keperluan pemuliaan pisang kepok di masa mendatang. Teknik identifikasi berdasarkan karakter morfologi diperlukan untuk memperoleh informasi mengenai pisang kepok. Namun, teknik identifikasi morfologi kurang efektif karena bersifat subjektif sehingga harus dilengkapi dengan teknik molekuler. Salah satu teknik molekuler yang sering digunakan dalam identifikasi pisang adalah RAPD. Teknik RAPD pada penelitian ini menggunakan primer OPA 2, OPA 3, OPA 4, OPA 11, OPA 12, dan OPA 18. Jenis penelitian ini adalah deskriptif eksploratif yang mengidentifikasi dan menganalisis keragaman genetik pisang kepok di Kabupaten Malang berdasarkan karakter morfologi dan molekuler RAPD. penelitian ini terdiri dari beberapa tahap yaitu pengambilan sampel di beberapa daerah Kabupaten Malang, identifikasi sampel dan analisis keragaman genetik berdasarkan karakter morfologi dan molekuler RAPD serta analisis kekuatan primer. Hasil karakterisasi pisang kepok berdasarkan karakter morfologi menunjukkan bahwa terdapat 4 jenis kultivar yang ditemukan di Kabupaten Malang yaitu: kepok abang, kepok putih, kepok australi dan kepok manurun yang seluruhnya bergenom ABB. Pisang kepok mengelompok berdasarkan jenis kultivarnya menjadi 3 cluster. Namun pada karakterisasi molekuler RAPD, pisang kepok tidak mengelompok dengan baik. Keragaman genetik pisang kepok di Kabupaten Malang secara morfologi dan molekuler RAPD tergolong tinggi dengan nilai He >0.3. Hasil amplifikasi menunjukkan bahwa primr OPA 3, 11 dan 18 mempu menghasilkan fragmen paling polimorfik yang ditinjau dari PIC, EMR, MI dan RP.
ENGLISH:
East Java is the highest banana production area in Indonesia. Malang Regency is largest supplier. One of banana cultivated in Malang is kepok banana. The geographical conditions of Malang Regency affect the diversity of kepok bananas. However, the Kepok banana nomenclature is the problem. So, it necessary to identified. Moreover, the genetic diversity of kepok bananas in Malang Regency has not been analyzed properly. Analysis of genetic diversity is needed for the purposes of breeding kepok bananas. Identification techniques based on morphological characters are needed to obtain information about kepok bananas. However, the morphological characterization is less effective because a subjectivity. So, it must be equipped with molecular techniques. One of the molecular techniques used in banana identification is RAPD. The RAPD technique in this study used OPA 2, OPA 3, OPA 4, OPA 11, OPA 12 and OPA 18. The type of this research is descriptive explorative. This study consisted of several stages, sampling, sample identification and analysis of genetic diversity based on the morphological and molecular characters of RAPD and analysis of effectivity primer. The results characterization of kepok bananas based on morphological characters showed that there are 4 types o cultivars that found in Malang Regency, namely: kepok abang, kepok putih, kepok australi and kepok manurun, all of that had the ABB genome. Kepok bananas are grouped based on the type of cultivar into 3 clusters. However, in the molecular characterization of RAPD, kepok bananas did not group well. The genetic diversity of kepok bananas in Malang Regency morphologically and molecularly RAPD is high with He value > 0.3. The amplification results showed that OPA 3, 11 and 18 primers were able to produce the most polymorphic fragments in terms of PIC, EMR, MI and RP.
ARABIC:
جاوى الشرقية هي أعلى منطقة لإنتاج الموز في إندونيسيا، وخاصة مالانج باعتبارها أكبر مورد. أحد أصناف الموز المزروعة في مالانج هو الموز الكيبوك. قد تؤثر الظروف الجغرافية لـمالانج مع مختلف الارتفاعات وأنواع التربة على تنوع الموز الكيبوك. ومع ذلك ، فإن نظام تسمية الموز الكيبوك في مالانج مختلف. الاختلاف في التسمية يجعل الموز الكيبوك بحاجة إلى تحديد لمعرفة أوجه التشابه والاختلاف الجينية. علاوة على ذلك، لم يتم تحليل التنوع الجيني للموز الكيبوك في مالانج بشكل صحيح ، لذا فإن تحليل التنوع الجيني ضروري لأغراض تربية الموز الكيبوك في المستقبل. تقنيات تحديد على أساس الخصائص المورفولوجية محتاجة للحصول على معلومات حول الموز الكيبوك. ومع ذلك ، فإن تقنية التحديد المورفولوجي أقل فعالية لأنها ذاتية لذا يجب أن تكون مجهزة بتقنيات جزيئية. إحدى من التقنيات الجزيئية التي غالبا ما تستخدم في تحديد الموز هي RAPD. استخدمت تقنية RAPD في هذا البحث بادئات OPA 2,OPA 3, OPA 4, OPA 11, OPA 12, OPA 18. نوع البحث في هذا البحث هو استكشافي وصفي يحدد ويحلل التنوع الجيني لموز الكيبوك في مالانج بناءً على الخصائص المورفولوجية والجزيئية لـ RAPD. يتألف هذا البحث من عدة مراحل ، وهي أخذ العينات في عدة مناطق من مالانج ، وتحديد العينة وتحليل التنوع الجيني بناءً على الخصائص المورفولوجية والجزيئية لـ RAPD وتحليل القوة الأولية. أظهرت نتائج توصيف الموز الكيبوك بناءً على الخصائص المورفولوجية أن هناك 4 أنواع من الأصناف الموجودة في مالانج، وهي: الكيبوك الأحمر ، والكيبوك الأبيض ، والكيبوك الأسترالي ، ومانورون كيبوك ، وكلها تحتوي على جينوم ABB. تم تجميع الموز الكيبوك على أساس نوع الصنف في 3 مجموعات. ولكن، في التوصيف الجزيئي لـ RAPD ، لا يتجمع موز الكيبوك جيدًا. التنوع الجيني لموز الكيبوك في مالانج من الناحية الشكلية والجزيئية RAPD مرتفع بقيمة He > 0.3. أظهرت نتائج التضخيم أن البادئات OPA 3 و 11 و 18 كانت قادرة على إنتاج الأجزاء الأكثر تعدد الأشكال من حيث ,PIC ,EMR ,MI RP.
Item Type: | Thesis (Undergraduate) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Supervisor: | Wahyudi, Didik and Prasetyo, Oky Bagas | |||||||||
Contributors: |
|
|||||||||
Keywords: | Kabupaten Malang; karakter morfologi; keragaman; pisang kepok; RAPD; diversity; kepok banana; malang regency; morphologycal character; RAPD; التنوع ; الموز الكيبوك ;مالانج الشخصيات المورفولوجية; RAPD | |||||||||
Subjects: | 06 BIOLOGICAL SCIENCES > 0604 Genetics > 060411 Population, Ecological and Evolutionary Genetics 06 BIOLOGICAL SCIENCES > 0607 Plant Biology > 060799 Plant Biology not elsewhere classified |
|||||||||
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Biologi | |||||||||
Depositing User: | Zahrobatul Lil Ilmi | |||||||||
Date Deposited: | 22 Jul 2021 11:39 | |||||||||
Last Modified: | 22 Jul 2021 11:39 | |||||||||
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/29552 |
Downloads
Downloads per month over past year
Actions (login required)
View Item |