Karakterisasi dan variasi genetik mangga (Mangifera spp.) Koleksi Kebun Raya Purwodadi Pasuruan

INDONESIA:

Mangga adalah salah satu tumbuhan berbuah di daerah tropis yang banyak dimanfaatkan sebagai bahan konsumsi. Mangga memiliki jenis, kultivar dan kerabat spesies yang beraneka ragam serta perlu dijaga sebagai plasma nutfah. Karakterisasi mangga dapat dilakukan berdasarkan karakter morfologi dan molekuler. Karakter morfologi dapat dijadikan sebagai dasar karakterisasi suatu taksa, sedangkan karakter genotip dapat dijadikan sebagai penguat dan karakterisasi lanjutan dalam mangga. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mencirikan dan mengetahui variasi genetik pada beberapa aksesi mangga lokal koleksi Kebun Raya Purwodadi Pasuruan. Karakterisasi dilakukan berdasarkan karakter morfologi vegetatif dan karakter molekuler atau genotip dari tiap aksesi. Karakterisasi molekuler pada penelitian ini menggunakan metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Hasil dari penelitian ini diharapkan dapat menjadi acuan dalam strategi konservasi mangga lokal di Indonesia. Penelitian ini menggunakan 10 aksesi mangga koleksi Kebun Raya Purwodadi. Hasil karakterisasi morfologi berupa skoring digunakan dalam tahap analisis pengelompokan dan koefisien similaritas untuk mengetahui keragaman genetik. Karakterisasi molekuler dengan metode RAPD dilakukan menggunakan primer OPA 1-20. Hasil amplifikasi berupa skoring pita DNA dari tiap aksesi digunakan dalam tahap analisis pengelompokan, koefisian similaritas, dan analisis variasi genetik dan heterozigositas. Sebanyak 10 aksesi mangga koleksi Kebun Raya Purwodadi memiliki karakter morfologi yang beragam dan karakter yang seragam. Analisis pengelompokan berdasarkan karakter morfologi menunjukkan bahwa 10 aksesi mangga mengelompok menjadi 4 grup. Analisis pengelompokan berdasarkan karakter genotip menunjukkan bahwa 10 aksesi mangga mengelompok menjadi 4 grup. Variasi genetik pada 10 aksesi mangga ini tergolong sedang pada marka morfologi dan cenderung tinggi pada marka RAPD.

ENGLISH:

Mango is one of many fruiting plants in tropical area that has been used as consumptional needs. Mango has high diversity of species, cultivars, and also related species, thus mango germplasms has to be conserved. Mango characterization could be done based on morphological and molecular marker. The morphological traits can be used as a basic approach of characterization and molecular markers as advanced approach in studies about mango. The goals of this research are to characterize and understanding the genetic variation of several local mango accession in Purwodadi Botanic Garden, Pasuruan. The characterization has done by vegetative morphological and molecular traits of each accession. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) method is used in this molecular characterization. The outcome of this research hopefully can be use in conservation strategies of Indonesian local mangoes. At least 10 mangoes accessions in Purwodadi Botanic Garden are used in this research.The morphological characterization produced a scoring of traits that used in clustering analysis and similarity coefficient to understanding the genetic variation. The molecular traits with RAPD method has been done by 20 OPA primers. The amplification results are DNA bands that used in clustering analysis, similarity coefficient, and genetic variation analysis also heterozigosity. Ten mangoes accessions in Purwodadi Botanic Garden have different and uniform morphological traits. Clustering analysis by morphological traits showed that these 10 mangoes are divided into 4 groups. Clustering analysis by molecular traits showed that 10 mangoes are separated into 4 groups. Genetic diversity in 10 mangoes moderate based on morphological markers and relatively high based on RAPD markers.

مستخلص البحث:

ملاجنو هو أحد النبااتت املثمرة يفاملناطق االستوائية واليت تستخدم على نطاق واسعلالستهالك. املاجنو هلا أنواع وأصناف وأقارب أنواع خمتلفة وحتتاج إىل احلفاظ عليها كبالزما وراثية.إجراء توصيف املاجنو بناء على اخلصائص املورفولوجية واجلزيئية. ميكن استخدام األحرفاملورفولوجية كأساس لتوصيف األصناف، بينما ميكن استخدام السمات الوراثية كتعزيز وتوصيفإضايف يف املاجنو. اهلدف من هذا البحث لتوصيف وحتديد االختالفات اجلينية يف العديد منمدخالت املاجنو احمللية من جمموعة حدائق بورودادي ابسوروان النباتية. مت إجراء التوصيف بناء ً علىالصفات املورفولوجية اخلضريةوالصفات اجلزيئية أو الوراثية لكل ساللة.التوصيف اجلزيئي يف هذاالبحث ابستخدامطريقةRandom Amplified Polymorphic DNA. من املتوقع أن تصبح نتائجهذا البحثمرجعا يف اسرتاتيجيات احلفاظ على املاجنو احمللية يف إندونيسيا.استخدم هذا البحث10مدخل ماجنو من جمموعةحدائق بورودادي ابسوروان النباتية. نتائج التوصيف املورفولوجي يفشكل تسجيل النقاطتستخدم يف مرحلة التحليل التجميعي ومعامل التشابه لتحديد التنوع اجليين.متإجراء التوصيف اجلزيئي بطريقةRAPDابستخدامابدائتOPA 1-20.ومت استخدام نتائجالتضخيم يف شكل تسجيل نطاقاحلمض النووي لكل مدخل يف حتليل التجميع ومعامل التشابهوحتليل التباين الوراثي وتغاير الزجيوت.ما جمموعه10مدخال من املاجنو يف جمموعة حدائقبورودادي ابسوروان النباتية هلا شخصيات مورفولوجية خمتلفة وشخصيات موحدة. أظهر حتليلالتجميع على أساس اخلصائص املورفولوجية أن مدخالت املاجنو اإلحدى عشرة مت جتميعها يف5جمموعات. وحتليل اجملموعات املعتمديدلعلى اخلصائص الوراثية أن مدخالت املاجنو اإلحدىعشر مت جتميعها يف4جمموعات.كانكان معامل التشابه بني هاتني الطريقتني للتوصيف مرتفعا واالختالف اجليين يف هذهاملدخالت اإلحدى عشر منخفضا