Studi in Silico senyawa Heliannuol a, b, c, d, dan e pada tanaman bunga matahari (Helianthus Annuus L.) terhadap reseptor Estrogen β (erβ) (2i0g)

مستخلص البحث

دوار الشمس (Helianthus annus L.) هو النبات الذي تم استخدامه تجريبيا ويحتوي على مختلف المركبات الكيميائية التي هي مفيدة لعلاج أنواع الأمراض المختلفة مثل السرطان. مركب هيليانيول هو من إحدى المركبات الكيميائية المضمونة في نبات دوار الشمس الواردة ويشمل السيسكويتربين (sesquiterpen) التي لديها نشاط لمضادة السرطان. مستقبلة هرمون الاستروجين هي من إحدى المستقبلات التي يمكن العثور عليها في بعض أجزاء أعضاء الجسم، حيث كانت يستطيع تثبيط السرطان نظرا لنتائج بحثية، خاصة سرطان الورم الدبقي.

يهدف هذا البحث إلى التنبؤ بسمية الخلايا، السمية والخصائص الكيميائية الفيزيائية لمركب هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ في السيليكو. يعتمد التنبؤ بالخصائص الفيزيائية الكيميائية على القاعدة الخمسة ليبينسكي والنظر إلى نتائج الامتصاص، التوزيع، التمثيل الغذائي، والإفراز باستخدام أداة التنبؤ الرقمية بخصائص الجزيئات الدوائية والسمية الصغيرة بالرسم البياني (pkCSM). التنبؤ بسمية المركب باستخدام أداة رقمية pkCSM و Protox II. في حين أن التنبؤ بالتفاعل بين ربيطة (ligand) و المستقبلات باستخدام Molegro Virtual Docker (MVD). يكون التحقق من صحة المستقبلة صالحا إذا كانت قيمة RMSD ≤2. بروتين مستقبلة السرطان المستخدم هو هرمون الاستروجينβ (PDB:2I0G).

أظهرت النتائج أن هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ تستوفي القاعدة الخمسة ليبينسكي، و هيليانيول د لديها أدنى سمية بقيمة LD50 : 2.841 ملغم/كغ. تعتبر مستقبلة2I0G (A) صالحة إذا كانت قيمة RMSD ≤2. هيليانيول هـ لديها أدنى درجة متوسطة من تصنيف مركبات الاختبار الأخرى بقيمة - ٨٠.٢٤٥ سعر حراري / مول.وأشار ربيطة الهيدروجين في الأحماض الأمينية الفعالة إلى نشاط مركبات هيليانيول. وكانت مركبة هيليانيول ج لها أكثر ربيطة الأحماض الأمينية ومماثلة لمركب Erteberel المقارن وهو Glu 305 و Arg 346.

ABSTRACT

Helianthus annuus L. is a plant that has been used empirically and it contains a variety of chemical uses that are useful for treating various types of diseases such as cancer. Heliannuols compound is one of the chemical compounds contained in Helianthus annuusL. It includes the group of sesquiterpenes which are reported to have activity as anticancer. Estrogen Receptors are one of the receptors that can be found in several parts of the body. At this time Estrogen Receptors are examined for their ability to inhibit the glioma cancer.

This research aims to predict cytotoxic, toxicity and chemical physical properties of the compounds of Heliannuol A, B, C, D dan E with in silico. Physical physicochemical predictions are based on the five Lipinski laws and also see the results of absorption, distribution, metabolism, and excretion by using the pkCSM online tool. Prediction of compound toxicity uses the pkCSM online tool and the Protox II online tool. While the prediction of ligand interactions with receptors uses Molegro Virtual Docker (MVD). Receptor validation is valid if the RMSD value is ≤2. The cancer receptor protein used is estrogen β (PDB: 2I0G).

The result shows that heliannuol A, B, C, D and E meet the five Lipinski laws, and heliannuol D has the lowest toxicity with a value of LD50 2.148 mg / kg. The receptor of 2I0G(A) is declared valid with a value of RMSD ≤2. The heliannuol E compound has the lowest Rerank Score among the other test compounds. It is -80.245 kkal/mol. The activity of heliannuol compounds is shown by hydrogen bonds in active amino acids. Heliannuol C has the most amino acid bonds similar to those of the Erteberel comparison compounds of Glu 305 and Arg 346.

ABSTRAK

Helianthus annuus L. merupakan tanaman yang telah digunakan secara empiris serta mengandung berbagai senyawa kimia yang bermanfaat untuk mengobati berbagai jenis penyakit seperti kanker. Senyawa Heliannuols merupakan salah satu senyawa kimia yang terkandung dalam Helianthus annuus L. dan termasuk golongan seskuiterpen yang dilaporkan memiliki aktivitas sebagai antikanker. Reseptor estrogen merupakan salah satu reseptor yang dapat ditemukan pada beberapa bagian organ tubuh, yang mana saat ini diteliti mengenai kemampuannya dalam menghambat kanker terutama kanker glioma.

Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk memprediksi sitotoksik, toksisitas dan sifat fisikokimia dari senyawa Heliannuol A, B, C, D dan E secara in silico. Prediksi sifat fisikokimia didasarkan pada hukum lima Lipinski dan juga melihat hasil absorbsi, distribusi, metabolisme, dan ekskresi dengan menggunakan pkCSM online tool. Prediksi toksisitas senyawa dengan menggunakan pkCSM online tool dan Protox II online tool. Sedangkan prediksi interaksi ligan dengan reseptor menggunakan Molegro Virtual Docker (MVD). Validasi reseptor dikatakan valid jika nilai RMSD ≤2. Protein reseptor kanker yang digunakan adalah estrogen β (PDB:2I0G).

Hasil menunjukkan bahwa Heliannuol A, B, C, D dan E memenuhi hukum lima Lipinski, dan Heliannuol D memiliki toksisitas paling rendah dengan nilai LD50 2.148 mg/kg. Reseptor 2I0G (A) dinyatakan valid dengan nilai RMSD ≤2. Senyawa Heliannuol E memiliki nilai Rerank Score paling rendah diantara senyawa uji lainnya yaitu -80,245 kkal/mol. Aktivitas senyawa Heliannuol ditunjukkan oleh ikatan hidrogen pada asam amino yang aktif dan Heliannuol C memiliki ikatan asam amino yang paling banyak mirip dengan senyawa pembanding Erteberel yaitu Glu 305 dan Arg 346.