#NOPUBLISH 5/7/2023# Analisis variasi genetik hasil induksi sinar gamma pada biji porang (amorphophallus muelleri blume) menggunakan marka molekuler issr (inter simple sequence repeat)

ABSTRAK:

Porang (Amorphophallus muelleri Blume) merupakan tanaman umbi-umbian dari keluarga Araceae. Umbi porang memiliki kandungan glukomanan paling tinggi berkisar antara 47-55 %. Ekspor porang berpotensi menjadi peluang peningkatan perekonomian masyarakat, namun ketersediaan porang yang terbatas perlu dilakukan pemuliaan tanaman. Pemuliaan tanaman dapat dilakukan salah satunya dengan induksi mutasi yaitu menggunakan sinar gamma. Pemuliaan mutasi dilakukan pada biji porang, karena radiasi pengion dari sinar gamma dapat menembus biji yang menyebabkan perubahan pada sekuen DNA untuk menghasilkan variasi genetik. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif kualitatif dengan pemberian 6 dosis sinar gamma berbeda yaitu: 0 (kontrol), 2 Gy, 4 Gy, 6 Gy, 8 Gy, dan 10 Gy. Isolasi DNA porang menggunakan metode CTAB (cetyl trimethyl ammonium bromide). Amplifikasi DNA porang menggunakan metode PCR dengan primer 6 ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Hasil data molekuler kemudian diolah hingga didapatkan analisis klaster dan dendogram
dengan program NTSYS-pc versi 2.10 Untuk analisis klaster dan dendogram kekerabarabatan menggunakan metode Unweight Pair Grup Method Using Aritmatic Method (UPGMA) dengan rumus Jaccard’s Similirity dilakukan analisis similaritas pada masing-masing pita. Hasil analisis kinerja kekuatan primer
menunjukkan bahwa primer ISSR-17889B adalah yang terbaik. Setelah mendapatkan kesamaan dan dendogram untuk setiap tanaman, 3 cluster terbentuk. Keragaman genetik yang tinggi ditunjukkan oleh pita-pita polimorfik dan monomorfik yang teramplifikasi. Terjadi induksi mutasi yang ditandai dengan
adanya perubahan dalam pita DNA.

ABSTRACT:

Porang (Amorphophallus muelleri Blume) is a tuber plant from the Araceae family. Porang tubers have a hight glucomannan content, which is around 47-55%. The export of porang has the potential to increase the people's economy, but the limited availability of porang makes plant breeding very important. Plant breeding can be practiced using several methods, one of them is by inducing mutations using gamma-rays. Mutation breeding is carried out on porang seeds, because ionizing radiation from gamma rays can be penetrate into the seeds which causes DNA sequence changes and produces genetic variation. This research used a qualitative
descriptive method with 6 different doses of gamma rays, namely: 0 (control), 2 Gy, 4 Gy, 6 Gy, 8 Gy, and 10 Gy. Porang DNA isolation using the CTAB (cetyl trimethyl ammonium bromide) method. DNA amplification in porang was carried out using the PCR method with 6 ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) primers. "The molecular data that has been obtained, then processed for cluster and dendrogram analysis using the NTSYS-pc version 2.10 program. For cluster and
dendogram analysis using the Unweight Pair Group Method Using Arithmatic Method (UPGMA) with the Jaccard's Similarity formula, a similarity analysis was performed for each band. The results of the primary strength performance analysis in this research indicated that the ISSR-17889B primer was the best among the others. In this research, 3 clusters were formed after the similarities and dendograms for each plant were known. High genetic diversity is indicated by amplified polymorphic and monomorphic bands. Mutation induction is indicated by changes in DNA bands.

خلاصة:

Araceae ) هو نبات درنة من عائلةAmorphophallus muelleri Blume( بورانتحتوي درناتالبورانج على أعلى محتوى من الجلوكومانان يتراوح بين .٪55-47تصدير البورانج لديه القدرة على أن
يصبح فرصة لتحسين اقتصاد المجتمع ، لكن التوافر المحدود للبورانج يتطلب تربية النبات. يمكن أن يتم
تربية النبات بطريقة واحدة مع تحريض الطفرة ، أي باستخدام أشعة جاما. يتم إجراء التكاثر الطفري على
بذور البورانج ، لأن الإشعاع المؤين من أشعة جاما يمكن أن يخترق البذور مما يتسبب في تغييرات في
تسلسل الحمض النووي لإنتاج التباين الجيني. استخدمت هذه الدراسة المنهج الوصفي النوعي بإعطاء 6
جرعات مختلفة من أشعة جاما وهي: ( 0تحكم) ، 2جراي ، 4جراي ، 6جراي ، 8جراي ، و 10جراي.
عزل DNA porangباستخدام طريقة .CTABتضخيم DNA Porangباستخدام طريقة PCRمع
التمهيدي ( ISSR 6تكرار التسلسل البسيط). تم بعد ذلك معالجة نتائج البيانات الجزيئية للحصول على
التحليل العنقودي والتصوير الشعاعي باستخدام الإصدار 2.10من برنامج .NTSYS-pcلتحليل القرابة
العنقودية والشعاع باستخدام طريقة Unweight Pair Groupباستخدام الطريقة الحسابية ()UPGMA
مع صيغة Jaccardللتشابه ، وتحليل التشابه لكل فرقة. أظهرت نتائج تحليل أداء قوة التمهيدي أن جهاز
ISSR-17889Bالتمهيدي كان الأفضل. بعد الحصول على التشابه و dendogramلكل نبات ، تم تشكيل
3مجموعات. يشار إلى التنوع الجيني العالي من خلال تضخيم العصابات متعددة الأشكال وأحادية الشكل.
يحدث تحريض الطفرة والذي يتميز بتغيير في نطاق الحمض النووي