#NOPUBLISH 4/7/2023# Pengaruh iradiasi gamma terhadap morfologi dan molekuler tanaman porang (amorphophallus muelleri blume) mutan menggunakan penanda molekuler gen matK (maturase K)

ABSTRAK:

Porang (Amorphophallus muelleri Blume) merupakan tumbuhan yang masuk ke dalam keluarga Araceae. Ketersediaan benih masih terbatas sehingga perlu adanya upaya peningkatan produktivitas dan kualitas porang dengan teknik mutasi menggunakan sinar gamma. Penggunaan biji dipilih sebagai agen mutan karena radiasi pengion sinar gamma dapat menembus biji yang menyebabkan perubahan pada sekuen DNA. Analisis variasi genetik porang hasil iradiasi gamma dilakukan melalui pendekatan morfologi dan molekuler menggunakan gen matK. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif
kualitatif dengan pemberian 6 dosis sinar gamma berbeda yakni: 0 Gy, 2 Gy, 4 Gy, 6 Gy, 8 Gy, dan 10 Gy. Amplifikasi DNA dilakukan dengan menggunakan primer matK 1248R dan primer matK 472F. Analisis variasi genetik menggunakan Mega XI. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa iradiasi gamma memengaruhi panjang akar, daun, batang, lebar daun, serta bentuk dan warna daun. Iradiasi pada dosisi 8 Gy dan 10 Gy
menyebabkan penurunan kelangsungan hidup. Hasil sekuen yang telah dianalisis menggunakan Mega XI dengan metode Neighbor Joining menunjukkan 1 in group yang terdiri dari 4 Gy 2b, 6 Gy 2, 4 Gy 2a, 4 Gy 1, 2 Gy 5b, 2 Gy 5a, 2 Gy 2b, 2 Gy 2a, 2
Gy 1, 0 Gy 1, 0 Gy 2 dan 0 Gy 3 serta 1 out group yang terdiri dari Amorphophallus muelleri clone 4 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast dan Amorphophallus muelleri clone 5 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast. Analisis kekerabatan genetik diperkuat berdasarkan nilai Pairwais Distance yang menunjukkan nilai 0,0000 pada 12 sampel porang dan nilai 0,00138 pada
Amorphophallus muelleri clone 4 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast dan Amorphophallus muelleri clone 5 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast. Analisis mutasi pada 14 sekuen matK menunjukkan adanya satu variable
region dan singleton yang terbentuk.

ABSTRACT:

Porang Porang (Amorphophallus muelleri Blume) is a plant that belongs to the Araceae family. The availability of seeds is still limited so it is necessary to increase the productivity and quality of porang by mutation techniques using gamma rays. The use of seeds was chosen as a mutant agent because gamma ionizing radiation can penetrate seeds that cause changes in DNA sequences. Analysis of genetic variation of gamma-irradiated porang was conducted through
morphological and molecular approaches using the matK gene. This research is a descriptive qualitative research by giving 6 different doses of gamma rays namely: 0 Gy, 2 Gy, 4 Gy, 6 Gy, 8 Gy, and 10 Gy. DNA amplification was performed using primer matK 1248R and primer matK 472F. Analysis of genetic variation using Mega XI. The results showed that gamma irradiation affected root length, leaf, stem, leaf width, and leaf shape and color. Irradiation at doses of 8
Gy and 10 Gy caused a decrease in survival. The results of sequences that have been analyzed using Mega XI with the Neighbor Joining method show 1 in group consisting of 4 Gy 2b, 6 Gy 2, 4 Gy 2a, 4 Gy 1, 2 Gy 5b, 2 Gy 5a, 2 Gy 2b, 2 Gy
2a, 2 Gy 1, 0 Gy 1, 0 Gy 2 and 0 Gy 3 and 1 out group consisting of Amorphophallus muelleri clone 4 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast and Amorphophallus muelleri clone 5 maturase K (matK) gene partial cds
chloroplast. Genetic kinship analysis is strengthened based on the Pairwais Distance value which shows a value of 0.0000 in 12 porang samples and a value of 0.00138 in Amorphophallus muelleri clone 4 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast and Amorphophallus muelleri clone 5 maturase K (matK) gene partial cds chloroplast. Mutation analysis on 14 matK sequences showed the presence of one variable region and singleton formed.

الملخص:

بورانج ( )Amorphophallus muelleri Blumeهو نبات ينتمي إلى عائلة .Araceaeلا يزال توافر البذور
محدودًا ، لذلك من الضروري زيادة إنتاجية وجودة البورنج باستخدام تقنيات الطفرات باستخدام أشعة جاما. تم اختيار
استخدام البذور كعامل متحور لأن الإشعاع المؤين لأشعة جاما يمكن أن يخترق البذوريسبب تغييرات في تسلسل
الحمض النووي. تم إجراء تحليل التباين الجيني للبورانج المشع بجاما من خلال الأساليب المورفولوجية والجزيئية
باستخدام جين .matKهذا البحث عبارة عن دراسة وصفية نوعية عن طريق إعطاء ٦جرعات مختلفة من أشعة
جاما وهي: ۰جراي ، ۲جراي ، ٤جراي ، ٦جراي ، ۸جراي ، و ا ۰جراي. تم إجراء تضخيم الحمض النووي
باستخدام بادئات matK 1248Rو .matK 472Fتحليل التباين الجينيباستخدام Megaا .۰تشير نتائج هذا البحث
إلى أن تشعيع جاما يؤثر على طول الجذر والأوراق والسيقان وعرض الورقة وشكل الورقة ولونها. أدى التشعيع
بجرعات Gy ۸و ا Gy ۰إلى انخفاض معدل البقاء على قيد الحياة. تظهر نتائج التسلسلات التي تم تحليلها باستخدام
Mega XIمع طريقة الربط الجار ا في المجموعة المكونة من ٤جراي ٦ ،b۲جراي ٤ ,۲جراي ٤ ,a۲جراي
ا, ۲جراي ۲b, ٥جراي ۲a, ٥جراي ۲b, ۲جراي ۲a, ۲جراي ا, ۰جراي ا, ۰جراي ۰ ، ۲جراي ٤و ا
CDs الجينmaturase K (matK) ٤ استنساخAmorphophallus muelleri خارج المجموعةتتكون من
CDs الجينmaturase K (matK) ٥ استنساخAmorphophallus muelleri الجزئي البلاستيدات الخضراء و
الجزئي البلاستيدات الخضراء . تم تعزيز تحليل القرابة الجينية بنا ًء على قيمة Pairwais Distanceالتي أظهرت
قيمة 0.0000في ۲ا عينة من الأشخاص وقيمة 0.00138بوصة.Amorphophallus muelleriاستنساخ ٤
٥ استنساخAmorphophallus muelleri الجزئي البلاستيدات الخضراء وcds الجينmaturase K (matK)
) maturase K (matKالجين cdsالجزئي البلاستيدات الخضراء. أظهر تحليل الطفرات لـ ٤ا تسلسل matKأن
هناك منطقة متغيرة واحدة وتشكلت مفردة