Analisis Network Pharmacology, Molecular Docking, dan Molecular Dynamics terhadap Potensi Afrodisiak Ekstrak Etanol 70% Kaulis Lelak (Uvaria rufa Blume) pada Terapi Disfungsi Ereksi

INDONESIA :

Disfungsi ereksi merupakan gangguan seksual dan diberikan terapi inhibitor PDE5 seperti sildenafil. Kaulis lelak (Uvaria rufa Blume) telah lama digunakan sebagai agen afrodisiak dan mengandung senyawa fitokimia yang berpotensi aktif terhadap mekanisme ereksi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis potensi afrodisiak senyawa fitokimia kaulis Uvaria rufa Blume dengan pendekatan in silicomelalui network pharmacology, molecular docking, molecular dynamics, profil HKSA, kemometrik, prediksi sifat fisikokimia, dan prediksi ADMET. Penelitian dilakukan dengan mengidentifikasi protein target menggunakan Swiss Target Prediction, PassOnline dan STRING; docking menggunakan Molegro Virtual Docker; simulasi molecular dynamics 50 ns dengan Desmond; analisis HKSA dan kemometrik menggunakan MDM, Chem3D, SwissADME, DeepPK, dan SPSS; serta prediksi Lipinski dan ADMET melalui SwissADME dan pkCSM. Hasil network pharmacology menunjukkan bahwa PDE5A merupakan target paling relevan dalam mekanisme disfungsi ereksi. Molecular docking menunjukkan bahwa senyawa 6-({1-Hydroxy-5-[(2-methyl-2-propanyl)oxy]-5-oxo-2-pentanyl}carbamoyl)-3a,4,5,7a-tetrahydro-1,3benzodioxol -4-yl4-{3-[(4,4-dimethyl-2-oxotetrahydro-3-furanyl)oxy]-3-oxo-1-propen-1-yl}benzoate memiliki afinitas terbaik (rerank score -139,118 kcal/mol). Sementara itu, hasil molecular dynamics menunjukkan bahwa senyawa aurantiamide acetate memiliki stabilitas, fleksibilitas, dan kompak kompleks paling baik dan mendekati native ligand serta sildenafil. Analisis HKSA, kemometrik, prediksi fisikokimia dan prediksi ADMET menempatkan senyawa aurantiamide acetate sebagai kandidat potensial dengan profil farmakokinetik paling aman. Senyawa aurantiamide acetate merupakan kandidat senyawa fitokimia kaulis Uvaria rufa Blume paling potensial sebagai agen afrodisiak dan inhibitor PDE5 sehingga layak untuk diuji lebih lanjut secara eksperimental.

ENGLISH :

Erectile dysfunction is a sexual disorder commonly treated with phosphodiesterase type 5 (PDE5) inhibitors such as sildenafil. Kaulis lelak (Uvaria rufa Blume) has long been traditionally used as an aphrodisiac and contains phytochemical compounds with potential activity in erectile mechanisms. This study aimed to analyze the aphrodisiac potential of phytochemical compounds from Uvaria rufa stem using an integrated in silicoapproach, including network pharmacology, molecular docking, molecular dynamics simulations, quantitative structure–activity relationship (HKSA) profiling, chemometric analysis, physicochemical property prediction, and ADMET evaluation. The study was conducted by identifying protein targets using Swiss Target Prediction, PASS Online, and STRING; molecular docking was performed using Molegro Virtual Docker; molecular dynamics simulations were carried out for 50 ns using Desmond; HKSA and chemometric analyses were conducted using MDM, Chem3D, SwissADME, DeepPK, and SPSS; while Lipinski’s rule of five and ADMET properties were predicted using SwissADME and pkCSM. Network pharmacology analysis revealed PDE5A as the most relevant target in the mechanism of erectile dysfunction. Molecular docking results showed that 6-({1-hydroxy-5-[(2-methyl-2-propanyl)oxy]-5-oxo-2-pentanyl}carbamoyl)-3a,4,5,7a-tetrahydro-1,3-benzodioxol-4-yl 4-{3-[(4,4-dimethyl-2-oxotetrahydro-3-furanyl)oxy]-3-oxo-1-propen-1-yl}benzoate exhibited the highest binding affinity (rerank score: −139.118 kcal/mol). Molecular dynamics simulations indicated that aurantiamide acetate demonstrated the best stability, flexibility, and compactness of the protein–ligand complex, closely resembling the native ligand and sildenafil. HKSA, chemometric analysis, physicochemical profiling, and ADMET prediction consistently identified aurantiamide acetate as the most promising compound with the safest pharmacokinetic profile. In conclusion, aurantiamide acetate is the most potential phytochemical compound from Uvaria rufa stem as an aphrodisiac agent and PDE5 inhibitor, warranting further experimental validation.

ARABIC :

يعتبر ضعف الانتصاب اضطرابًا جنسيًا ويتم علاجه بمثبطات PDE5 مثل السيلدينافيل. يستخدم Kaulis lelak (Uvaria rufa Blume) منذ فترة طويلة كمنشط جنسي ويحتوي على مركبات كيميائية نباتية قد تكون فعالة في آلية الانتصاب. استهدف هذا البحث الحاسوبي إلى تحليل الإمكانات المثيرة للجنسية للمركبات الكيميائية النباتية في Uvaria rufa Blume باستخدام نهج حاسوبي خلال علم الصيدلة الشبكي، والالتحام الجزيئي، والديناميكيات الجزيئية، وتحديد ملامح HKSA، والكيمياء القياسية، والتنبؤ بالخصائص الفيزيائية الكيميائية، والتنبؤ ADMET. أجري البحث خلال تحديد البروتينات المستهدفة باستخدام Swiss Target Prediction و PassOnline و STRING؛ والالتحام باستخدام Molegro Virtual Docker؛ ومحاكاة الديناميكيات الجزيئية 50 نانو ثانية باستخدام Desmond؛ وتحليل HKSA و kemometrik باستخدام MDM و Chem3D و SwissADME و DeepPK و SPSS؛ وتوقعات Lipinski و ADMET من خلال SwissADME و pkCSM. أظهرت نتائج علم الصيدلة الشبكي أن PDE5A كان الهدف الأكثر صلة بآلية ضعف الانتصاب. أظهر الالتحام الجزيئي أن المركب
6-({1-Hydroxy-5-[(2-methyl-2-propanyl)oxy]-5-oxo-2-pentanyl}carbamoyl)-3a,4,5,7a-tetrahydro-1,3benzodioxol-4-yl4-{3-[(4,4-dimethyl-2-oxotetrahydro-3-furanyl)oxy]-3-oxo-1-propen-1-yl}benzoate
له أفضل تقارب (درجة إعادة الترتيب-139.118 كيلو كالوري/مول). تظهر نتائج الديناميكيات الجزيئية أن أورانتياميد أسيتات يتمتع بأفضل استقرار ومرونة وكثافة، وقريب من الرابط الأصلي والسيلدينافيل. تشير توقعات HKSA و kemometrik والتوقعات الفيزيائية الكيميائية وتوقعات ADMET إلى أن أسيتات الأورانتياميد هي مادة مرشحة محتملة ذات خصائص دوائية آمنة. أسيتات الأورانتياميد هي المركب الكيميائي النباتي الأكثر واعدة من جذع Uvaria rufa Blume كمثير للشهوة ومثبط PDE5، مما يجعلها تستحق إجراء المزيد من الاختبارات التجريبية.