#NOPUBLISH 12/9/2024# STUDI IN SILICO ANALISIS POTENSI SENYAWA BIOAKTIF FRAKSI TRITERPEN GLIKOSIDA Holothuria atra SEBAGAI AGEN ANTIKANKER PAYUDARA

ABSTRAK:

Holothuria atra memiliki potensi sebagai agen antikanker payudara. Echinoside B dan Holothurin B merupakan senyawa bioaktif triterpen glikosida pada Holothuria atra yang diperkirakan memiliki kemampuan menghambat perkembangan kanker payudara. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui
mekanisme penghambatan kanker payudara oleh senyawa bioaktif Echinoside B dan Holothurin B melalui pendekatan in silico. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah network pharmacology, uji toksisitas senyawa bioaktif, dan molecular docking. Hasil network pharmacology menunjukkan bahwa STAT3 merupakan protein target utama dari senyawa bioaktif Echinoside B dan Holothurin B. Berdasarkan hasil uji sitotoksisitas juga diketahui bahwa kedua senyawa uji bersifat non toksik. Molecular docking dilakukan antara ligan Echinoside B dan Holothurin B terhadap protein STAT3. Hasil docking senyawa Echinoside B menunjukkan nilai RMSD 1,925 Å dan binding affinity -6,9 kcal/mol. Residu asam amino hasil docking Echinoside B dengan protein STAT3 adalah Ile659, Trp623, G638, Unk0, Arg609, Ser611, Glu594, Glu612. Hasil docking senyawa Holothurin B menunjukkan nilai RMSD 1,003 Å dan nilai binding affinity -7,8 kcal/mol. Residu asam amino hasil docking Holothurin B dengan protein STAT3 adalah Glu594, Ser636, Unk0, Arg609, Glu638, Pro639. Berdasarkan hasil molecular docking juga diketahui bahwa potensi Holothurin B dalam menghambat kanker payudara lebih baik dibandingkan dengan Echinoside B. Pengikatan ligan Echinoside B dan Holothurin B terletak pada domain SH2/STAT3. Hal ini menyebabkan terjadinya pemblokiran dimerisasi STAT3 sehingga dapat menghambat metastasis kanker payudara.

ABSTRACT:

Holothuria atra has potential as breast anticancer agent. Echinoside B and Holothurin B are bioactive triterpene glycoside compounds in Holothuria atra that are thought to have the ability to inhibit development of breast cancer. This study aims to determine the mechanism of breast cancer inhibition by bioactive compounds Echinoside B and Holothurin B through an in silico approach. The methods used in this research are network pharmacology, toxicity test of bioactive compounds, and molecular docking. The results of network pharmacology show that STAT3 is the main target protein of Echinoside B and Holothurin B. Based on the results of the cytotoxicity test, it is also known that both compounds are non-toxic. Molecular docking was performed between Echinoside B and Holothurin B ligands against STAT3 protein. The docking result of Echinoside B showed RMSD value 1.925 Å and binding affinity -6.9. Amino acid residues of Echinoside B docking results with STAT3 protein are Ile659, Trp623, G638, Unk0, Arg609, Ser611, Glu594, Glu612. Holothurin B docking results showed RMSD value 1.003 Å and binding affinity value -7.8. Amino acid residues of Holothurin B docking results with STAT3 protein are Glu594, Ser636, Unk0,Arg609, Glu638, Pro639. Based on the molecular docking results, it is also known that the potential of Holothurin B in inhibiting breast cancer is better than
Echinoside B. The binding of Echinoside B and Holothurin B ligands is located in the SH2/STAT3 domain. This causes the blocking of STAT3 dimerization so that it can inhibit breast cancer metastasis.

مستخلص البحث:

تتمتع نبته Holothuria atra بإمكانية استخدامها كعامل مضاد لسرطان الثدي. يعد مركبا Echinoside B و Holothurin B من مركبات Triterpen glikosida النشطة بيولوجيا في نبا Holothuria atra والتي يعتقد ان لها القدرة على تشبيط تطور سرطان الثادي. تهدف هذه الدراسة المركبات النشطة سرطان الثادي بواسطة المركبات النشطة بيولوجيا Echinoside B و Holothuri B من خلال نهج in silico. الطرق المستخدمة في هذا البحث هي علم الأدوية الشبكي، واختبار سمية المركبات النشطة بيولوجيًا، والالتحام الجزيئي. الطرق المستخدمة في هذا البحث هي علم الأدوية الشبكي، واختبار سمية المركبات النشطة بيولوجيًا، والالتحام الجزيئي. أظهرت نتائج علم العقاقير الشبكي أن بروتين STAT3 هو البروتين المستهدف الرئيسي للمركبات النشطة بيولوجيًا من مركبات Echinoside B وHolothurin B. واستنادًا إلى نتائج اختبار السمية الخلوية، من المعروف أيضًا أن كلا المركبين المختبرين غير سامّين. تم إجراء الإرساء الجزيئي بين رابطي Echinoside B وHolothurin B ضد بروتين STAT3. أظهرت نتيجة الإرساء لمركب Echinoside B قيمة RMSD تبلغ 1.925 Å وتقارب ارتباط قدره -6.9. وبقايا الأحماض الأمينية لنتائج إرساء مركب Echinoside B مع بروتين STAT3 هي Ile659، و Trp623، و G638، و G638، و Unk0، و Arg609، و Ser611، و Glu594، و Glu612. أظهرت نتيجة الالتحام لمركب هولوثورين ب قيمة RMSD تبلغ 1.003 Å وقيمة تقارب الارتباط -7.8. أما بقايا الأحماض الأمينية لنتائج الالتحام الجزيئي لمركب ”هولوثورين ب“ مع بروتين STAT3 فهي Glu594، وSer636، وUnk0، وArg609، وGlu638، وPro639. استنادًا إلى نتائج الالتحام الجزيئي، من المعروف أيضًا أن إمكانات هولوثورين ب في تثبيط سرطان الثدي أفضل من إيكينوسيد ب. ويقع ارتباط رابط رابطي Echinoside B وHolothurin B في مجال SH2/STAT3. وهذا يؤدي إلى منع ثنائية STAT3 بحيث يمكن أن يقلل من ورم خبيث سرطان الثدي.