#NOPUBLISH 19/7/2024# Studi in silico potensi antikanker metabolit sekunder tanaman beligo (Benincasa hispida) sebagai inhibitor tyrosine kinase

INDONESIA:
Kanker adalah penyakit ysng menyumbang angka kematian terbanyak di Dunia.. Salah satu terapi untuk mengobati kanker adalah terapi Epidermal Growth Factor Receptor-Tyrosine Kinase Inhibitors (EGFR-TKIs),salah satunya adalah erlotinib. , yang mekanisme kerjanya menghambat fosforilasi dan aktivitas tirosyne kinase dengan cara berkompetisi untuk berikatan pada ATP EGFR. Senyawa metabolit sekunder pada beligo (Benincasa hispida) diketahui memiliki kemampuan untuk menghambat aktivitas karsinogen dan mencegah metastasis sel ganas. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi aktivitas fisikokimia, toksisitas, dan aktivitas antikanker senyawa metabolit sekunder beligo terhadap reseptor tyrosine kinase dengan kode (1M17). Prediksi sifat fisikokimia dilakukan menggunakan aplikasi SwissADME dan mengacu ke hukum lima Lipinski. Selanjutnya, kelas toksisitas dilakukan menggunakan aplikasi pkCSM Online Tool dan Protox Online Tool. Hasil nilai LD50 dan klasifikasi kelas toksisitas digolongkan menurut GHS. Prediksi aktivitas senyawa terhadap reseptor dilakukan menggunakan aplikasi Molegro Virtual Docker (MVD). Reseptor tyrosin kinase (1M17) dikatakan valid karena mempunyai nilai RMSD dibawah ˂2 Å. Hasil penelitian menunjukkan bahwa senyawa metabolit sekunder hispidulin, katekin, naringenin, dan quercetin pada beligo diprediksi memiliki potensi sebagai inhibitor tyrosine kinase. Senyawa-senyawa tersebut memiliki BM dibawah 500 dalton, Log P kurang dari 5, HBA kurang dari 10, HBD kurang dari 5, yang berarti senyawa tersebut memenuhi parameter hukum Lipinski. Kelas toksisitas dari senyawa tersebut berturut turut adalah 5,6,4, dan 3, memenuhi parameter ames toxicity, hepatoxicity, dan skin senzition. Serta memiliki nilai rerank score berturut turut yaitu : -79.424, -77.663, -80.153, dan -84.423 Kcal/mol. Senyawa tersebut juga memilki ikatan sterik dan ikatan hidrogen yang mirip dengan erlotinib dari asam amino yang sama.

ENGLISH:
Cancer is a disease that contributes to the highest number of deaths in the world. One of the therapies to treat cancer is therapy Epidermal Growth Factor Receptor-Tyrosine Kinase Inhibitors (EGFR-TKIs),one of them is erlotinib, whose mechanism of action inhibits phosphorylation and activity tirosyne kinase by competing for binding to ATP EGFR. Secondary metabolite compounds in beligo (Benincasa hispida) is known to have the ability to inhibit carcinogenic activity and prevent malignant cell metastasis. This study aims to predict the physicochemical activity, toxicity and anticancer activity of beligo secondary metabolite compounds against receptors tyrosine kinase with code (1M17). Prediction of physicochemical properties is carried out using the application SwissADME and refers to Lipinski's law of five. Next, toxicity classes are carried out using the application pkCSM Online Tool and Protox Online Tool. LD50 value results and toxicity class classification is classified according to GHS. Prediction of compound activity against receptors is carried out using the application Molegro Virtual Docker (MVD). Receptor tyrosine kinase (1M17) is said to be valid because it has an RMSD value below ˂2 Å. The results showed that the secondary metabolite compounds hispidulin, catechin, naringenin, and quercetin in beligo were predicted to have potential as inhibitors. tyrosine kinase. Because the compound has a BM below 500 daltons, Log P less than 5, HBA less than 10, HBD less than 5, which means the compound meets the legal parameters Lipinski. The toxicity classes of these compounds are 5,6,4, and 3 respectively, meeting the parameters ames toxicity, hepatotoxicity, and skin sensitization. And it has consecutive rerank score values, namely: -79,424, -77,663, -80,153, and -84,423. The compound also has steric bonds and hydrogen bonds similar to erlotinib from the same amino acid.

ARAB:
يعدّ مرض السرطان ما يمثل أعلى معدل وفيات في العالم. من العلاجات للسرطان مثبطات مستقبلات عامل نمو البشرة - التيروزين كيناز (EGFR-TKIs)، منها erlotinib هو ما تمنع آلية عمله نشاط الفسفرة والتيروسين كيناز من خلال التنافس على الارتباط بـ ATP EGFR. يقال أن مركبات الأيض الثانوية في البيليجو (Benincasa hispida) لديها القدرة على تثبيط نشاط المواد المسرطنة ومنع ورم خبيث للخلايا الخبيثة. يستهدف هذا البحث إلى التوقع بالنشاط الفيزيائي الكيميائي والسمية والنشاط المضاد للسرطان لمركب مستقلب البيليجو الثانوية ضد مستقبلات التيروزين كيناز ذات رمز(1M17). تم إجراء التنبؤ بالخواص الفيزيائية والكيميائية باستخدام تطبيق SwissADME واعتمد إلى قانون Lipinski الخمسة. ومن ثم، تم تنفيذ فئة السمية باستخدام تطبيقات pkCSM بادواتها الإنترنتية وأدوات Protox الشبكية. يتم تصنيف نتيجة قيمة LD50 وتصنيف فئة السمية وفقاً لـ GHS. النشاط المركب المتوقع ضد المستقبلات يتم باستخدام تطبيق Molegro Virtual Docker (MVD). يقال إن مستقبلة التيروزين كيناز (1M17) صالح لأنه يحتوي على قيمة RMSD أقل من ˂2 Å. استنتج البحث أن مركب الأيض الثانوية من hispidulin و catechin و naringenin و quercetin في beligo كان من المتوقع أن له القدرة على مثبطات التيروزين كيناز. إذ أن المركب يحتوي على BM أقل من 500 دالتون، فإن Log P أقل من 5، و HBA أقل من 10، و HBD أقل من 5، يعني أن المركب متوافق بمعايير قانون Lipinski. فئات السمية للمركب هي 5،6،4 و 3 على التوالي، وتفي بمعايير سمية أميس، السمية الكبدية، وحساسية الجلد. ولديه درجات إعادة ترتيب متتالية: -79.424, -77.663, -80.153, و -84.423. يحتوي المركب أيضا على رابط ستيريك ورابط هيدروجينية مشابهة لـ erlotinib من نفس الحمض الأميني.