#NOPUBLISH 26/7/2024# Analisis keragaman genetik beberapa aksesi dan varietas abaka (Musa textilis Nee) berdasarkan penanda molekuler ISSR (Inter Simple Sequence Repeat)

ABSTRAK:

Abaka (Musa textilis Nee) adalah tanaman herba dari family Musaceae yang tumbuh di daerah beriklim tropis dan dapat menghasilkan serat berkualitas tinggi. Terdapat tujuh varietas abaka unggul yang telah diuji multilokasi, namun diversitas abaka di Indonesia masih tergolong sempit sebab pertumbuhannya yang terhambat serangan penyakit layu dan faktor abiotik. Deteksi keragaman genetik dapat dilakukan dengan teknik PCR ISSR yang mengamplifikasi fragmen DNA di antara mikrosatelit dan bersifat dominan. Penelitian ini bertujuan menentukan keragaman genetik sembilan kultivar abaka, termasuk lima varietas unggul (Hote Abakatas 1, Hote Abakatas 2, Hote Abakatas 3, Rote EMT, Rote BHJ), empat aksesi (UB/01, Tangongon, Tangongon EMS, Cocica) dari koleksi BPSI-TAS, dan satu sampel pisang barlin sebagai outgroup. Amplifikasi dilakukan dengan lima primer ISSR (UBC 810, UBC 812, UBC 807, UBC 836, UBC 811). Hasil menunjukkan penanda ISSR menghasilkan 68 lokus dengan 66 lokus bersifat polimorfis (97,03%) dan rata-rata 13,6 lokus per primer. ISSR dianggap efektif dan informatif untuk deteksi polimorfisme pada abaka, didukung dengan nilai PIC yang berkisar dari 0,30 (UBC 807) – 0,42 (UBC 812) dengan rata-rata 0,362 per primer, nilai EMR yang berkisar antara 121 (UBC 812) – 256 (UBC 811) dengan rata-rata 182,2 per primer, nilai MI pada kisaran 47,52 (UBC 807) - 105,92 (UBC 811) dengan rata-rata 66,312 dan Rp yang berkisar antara 8 (UBC 836) – 15,2 (UBC 811) dengan rata-rata 10,6 per primer. Primer UBC 811 dianggap paling informatif berdasarkan nilai TNB, EMR, MI, dan Rp tertinggi. Koefisien similaritas abaka berkisar antara 0,47 – 0,94. Dendogram berdasarkan metode UPGMA melalui software NTSYS-pc membagi sepuluh kultivar menjadi empat klaster dengan satu klaster sebagai outgroup (Musa acuminata). Klaster I terdiri dari UB/01, Tangongon EMS, dan Hote Abakatas 1. Klaster II terdiri dari Hote Abakatas 3, Hote Abakatas 2, Tangongon, Rote EMT dan Rote BHJ. Klaster III terdiri dari Cocica sebagai kelompok tersendiri.

ABSTRACT:
Abaca (Musa textilis Nee) is a herbaceous plant from Musaceae family that grows intropical climates and can produce high-quality fiber. There are seven superior abacavarieties that have been tested for multilocation, but the diversity of abaca in Indonesia isstill relatively narrow because its growth is hampered by wilt disease and abiotic factors.Detection of genetic diversity can be determined by ISSR PCR technique that amplifiesDNA fragments between microsatellites and is dominant. This study aims to determine thegenetic diversity of nine abaca cultivars, including five superior varieties (Hote Abakatas1, Hote Abakatas 2, Hote Abakatas 3, Rote EMT, Rote BHJ), four accessions (UB/01,Tangongon, Tangongon EMS, Cocica) from the BPSI-TAS collection, and one wild bananasample as an outgroup. Amplification was performed with five ISSR primers (UBC 810,UBC 812, UBC 807, UBC 836, UBC 811). Results showed that ISSR markers produced68 loci with 66 loci being polymorphic (97.03%) and an average of 13.6 loci per primer.ISSR is considered effective and informative for polymorphism detection in abaca,supported by PIC values ranging from 0.30 (UBC 807) - 0.42 (UBC 812) with an averageof 0.362 per primer, EMR values ranging from 121 (UBC 812) - 256 (UBC 811) with anaverage of 182.2 per primer, MI values in the range of 47.52 (UBC 807) - 105.92 (UBC811) with an average of 66.312 and Rp ranging from 8 (UBC 836) - 15.2 (UBC 811) withan average of 10.6 per primer. Primer UBC 811 was considered the most informative basedon the highest TNB, EMR, MI and Rp values. The similarity coefficient of abaca rangedfrom 0.47 to 0.94. Dendrogram based on the UPGMA method through NTSYS-pc softwaredivided ten cultivars into four clusters with one cluster as an outgroup (Musa acuminata).Cluster I consists of UB/01, Tangongon EMS, and Hote Abakatas 1. Cluster II consists ofHote Abakatas 3, Hote Abakatas 2, Tangongon, Rote EMT and Rote BHJ. Cluster IIIconsists of Cocica as a separate group

مستخلص البحث:

األابكا (Musa textilis Nee) هو نبات عشيب من الفصيلة املوسوية ينمو يف املناخات االستوائية وميكنه إنتاج ألياف عالية اجلودة.وتوجد سبعة أصناف متفوقة من األابكا مت اختبارها يف مواقع متعددة، ولكن تنوع األابكا يف إندونيسيا ال يزال ضيقا ً نسبيا ً ألن منوهايعوقه مرض الذبول والعوامل الالأحيائية. ميكن الكشف عن التنوع الوراثي ابستخدام تقنية تفاعل البوليمرياز املتسلسل املتسلسلISSRاليت تضخم أجزاء احلمض النووي بني السالالت الدقيقة وهي السائدة. هتدف هذه الدراسة إ َل حتديد التنوع الوراثي لتسعة أصنافمن األابكا، مبا يف ذلك مخسة أصناف متفوقة (أابكااتس1، أابكااتس2، أابكااتس3، رويتEMT، رويتBHJ)، وأربعة أصناف(UB/01، اتنغونغون، اتنغونغونEMS، كوسيكا) من جمموعة معهد حبوث النبااتت يف اتس، وعينة موزة برية واحدة كمجموعةخارجية. أُجريت عملية التضخيم ابستخدام مخسة ابدائت ملقاييس البادائت الدوليةISSR UBC 810،UBC 812،UBC807،UBC 836،UBC 811. أظهرت النتائج أن الوامسات ذات املبادىء الدولية للقاحISSRأنتجت68موقعا ً مع وجود66موقعا ً متعدد األشكال(97.03)%ومتوسط13.6موقعا ً لكل ابدئة. يعترب املؤشر الدويل لتعدد األشكال فعاال ً وغنيا ً ابملعلوماتللكشف عن تعدد األشكال يف األابكا، مدعوما ً بقيمPICاليت ترتاوح بني0.30(I-11) - 0.42 (UBC 812)مبتوسط0.362لكل مُستَهل, قيمEMRترتاوح بني121(UBC 812) - 256 (UBC 811)مبتوسط182.2لكل برامير، وقيمMIيف نطاق47.52(I-11) - 105.92 (UBC 811)مبتوسط66.312وRpترتاوح بني8(T-9) - 15.2 (UBC 811)مبتوسط10.6لكل برامير. اعتُرب البادئةUBC 811َل أعلى قيم ملعامل التشابه األكثر إفادة ً استنادًا إTNB، ومعامل التشابه الكهرومغناطيسي،ومعامل التشابه املتوسط، ومعامل التشابه املتوسط، ومعامل التشابه العكسي. تراوح معامل تشابه األابكا بني0.47-0.94. قسمتاملخططات الشجرية املستندة إ َل طريقةUPGMAمن خالل برانمجNTSYS-pcاألصناف العشرة إ َل أربع جمموعات مع جمموعةواحدة كمجموعة خارجية (موسى أكميناات). تتكون اجملموعة األو َل منUB/01، واتجنوجنوجنونEMS، وأابكااتس1، وتتكوناجملموعة الثانية من أابكااتس3، وأابكااتس2، واتجنوجنوجنون، وروتEMT، وروتBHJكاكا، وتتكون اجملموعة الثالثة من كوكمجموعة منفصلة.