Mubarok, Muhammad Zidan (2023) Identifikasi senyawa antivirus sars-COV-2 dari ekstrak etanol 96% daun jambu biji (Psidium guajava) dengan metode UPLC-MS/MS. Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
![]() |
Text (Fulltext)
19930071.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (2MB) |
Abstract
ABSTRAK:
SARS-COV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirusses 2) merupakan jenis virus penyebab penyakit Coronavirus Disease – 19 (COVID – 19) yang telah menjadi pandemic pada akhir tahun 2019. Jambu biji (Psidium guajava) merupakan tanaman herbal yang banyak dimanfaatkan sebagai terapi pengobatan terhadap berbagai macam penyakit. Kandungan yang terdapat didalamnya memiliki aktivitas biologis yang bermanfaat banyak untuk tubuh salah satunya yaitu sebagai antioksidan. Antioksidan memiliki peranan penting dalam tubuh yaitu untuk membantu proses penghambatan terhadap reaksi oksidasi. Infeksi virus dapat terjadi karena terdapat radikal bebas yang dihasilkan dari reaksi oksidasi. Protein non-struktural pada SARS-COV-2 seperti 3CLPro (3 Cysteine Like Proteinase) memiliki peranan penting dalam proses replikasi sel. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa yang berpotensi sebagai antivirus SARS-COV-2. Instrumen UPLC-MS/MS digunakan untuk mengidentifikasi kandungan senyawa yang terdapat pada ekstrak daun jambu biji. Sebelum dilakukan prediksi aktivitas senyawa, dilakukan uji sifat fisikokimia secara in silico dengan SwissADME. Parameter acuan hasil uji sifat fisikokimia menggunakan hukum lima Lipinski. Selanjutnya dilakukan uji toksisitas secara in silico menggunakan ProTox Online Tools. Hasil uji toksisitas menggunakan nilai LD50 dan klasifikasi kelas toksisitas yang mengacu pada GHS (Globally Harmonized System). Senyawa Methyl alpha-D-mannoside memiliki nilai LD50 tertinggi yaitu 23000 mg/kg, yang tergolong pada kelas 6. Proses selanjutnya dilakukan prediksi aktivitas menggunakan website PASS Online. Prediksi aktivitas senyawa dilakukan berdasarkan nilai PA (Potential Activity). Senyawa Phenylacetyl disulfide diprediksi memiliki aktivitas sebagai penghambat 3CLPro dengan nilai PA tertinggi yaitu 0,290. Senyawa Morin (PA : 0,850) dan Isorhamnetin (PA : 0,806) diprediksi memiliki aktivitas sebagai antioksidan. Berdasrkan hasil penelitian ini kami rekomendasikan untuk dilakukan penelitian lebih lanjut secara in vitro ataupun in vivo dalam pengembanagn ekstrak jambu biji sebagai kandidat obat antivirus SARS-COV-2.
ABSTRACT:
SARS-COV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) is a type of virus that causes Coronavirus Disease – 19 (COVID – 19) which has become a pandemic at the end of 2019. Guava (Psidium guajava) is an herbal plant that is widely used as a therapeutic treatment for various diseases. The content contained in it has many beneficial biological activities for the body, one of which is as an antioxidant. Antioxidants have an important role in the body, namely to help inhibit the process of oxidation reactions. Viral infections can occur because there are free radicals produced from oxidation reactions. Non-structural proteins in SARS-COV-2 such as 3CLPro (3 Cysteine Like Proteinase) have an important role in the process of cell replication. This study aims to identify compounds that have potential as antiviral agents for SARS-COV-2. The UPLC-MS/MS instrument was used to identify the compounds contained in guava leaf extract. Before predicting the activity of the compound, an in silico physicochemical test was carried out with SwissADME. The reference parameter for the physicochemical properties test uses Lipinski's five laws. Furthermore, an in silico toxicity test was carried out using ProTox Online Tools. The results of the toxicity test use the LD50 value and the classification of the toxicity class refers to the GHS (Globally Harmonized System). Methyl alpha-D-mannoside compound has the highest LD50 value of 23000 mg/kg, which belongs to 6th class. The next process is predicting activity using the PASS Online website. The prediction of compound activity is based on the PA (Potential Activity) value. Phenylacetyl disulfide is predicted to have activity as a 3CLPro inhibitor with the highest PA value of 0.290. Morin compounds (PA : 0.850) and Isorhamnetin (PA : 0.806) are predicted to have activity as antioxidants. Based on the results of this study, we recommend conducting further research in vitro or in vivo in the development of guava extract as a candidate for a SARS-COV-2 antiviral drug.
مستخلص البحث:
المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS COV-2) هي نوع من الفيروسات المسبب لمرض فيروس كورونا-19 (COVID – 19) الذي أصبح وباءً في نهاية عام 2019م. الجوافة (بسيديوم جوافة) نبات عشبي له فوائد عديدة كعلاج للأمراض المختلفة. يحتوي المحتوى الموجود فيه على العديد من الأنشطة البيولوجية المفيدة للجسم، أحدها كمضادات للأكسدة. تلعب مضادات الأكسدة دورا مهما في الجسم وهي للمساعدة في عملية تثبيط تفاعل الأكسدة. تحدث العدوى الفيروسية بسبب وجود جذور حرة تنتج من تفاعل الأكسدة. تلعب البروتينات غير الهيكلية في المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS COV-2) مثل 3 السيستين مثل البروتياز (3CLPro) دورا مهما في عملية تكرار الخلية. يهدف هذا البحث إلى تحديد المركبات التي يمكن أن تكون عوامل مضادة للفيروس المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS COV-2). ويستخدم هذا البحث أداة الكروماتوغرافيا السائلة فائقة الأداء-قياس الطيف الكتلي الترادفي (UPLC-MS/MS) لتحديد المركبات الموجودة في مستخلص أوراق الجوافة. تم اختبار الخصائص الفيزيائية والكيميائية في السيليكو باستخدام سويسأدمي (SwissADME) للتنبؤ بنشاط المركبات. المعايير المرجعية لنتائج اختبار الخصائص الفيزيائية والكيميائية تستخدم قوانين ليبينسكي الخمسة. ثم تم إجراء سمية السيليكو باستخدام أدوات بور توكس عبر الإنترنت (ProTox Online Tools). تستخدم نتائج اختبار السمية قيمة LD50 ويشير تصنيف فئة السمية إلى النظام المنسق عالميا. ويحتوي مركب ميثيل ألفا-د-مانوسيد على أعلى قيمة LD50 تبلغ 23000 مجم/كجم، والتي تنتمي إلى الفئة 6. العملية التالية هي توقع النشاط باستخدام موقع باس عبر الإنترنت (PASS Online). يعتمد التنبؤ بالنشاط المركب على قيمة النشاط المحتمل. تم تنبؤ سينياوا ثنائي كبريتيد فينيل أسيتيل له نشاط كمثبط 3 السيستين مثل البروتياز بقيمة النشاط المحتمل تبلغ 0.290. وتم تنبؤ مركب مورين (النشاط المحتمل: 0.850) وإيسور هامينتين (النشاط المحتمل: 0.806) لع نشاط مضاد للأكسدة. بناء على نتائج هذا البحث، يوصي الباحث بإجراء مزيد من الأبحاث في المختبر أو في الجسم الحي في تطوير مستخلص الجوافة كمرشح لعقار مضاد للفيروسات المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS COV-2).
Item Type: | Thesis (Undergraduate) |
---|---|
Supervisor: | Muti'ah, Roihatul and Dewi, Tanaya Jati Dharma |
Keywords: | Antivirus; SARS-COV-2; Psidium guajava; Metabolite Profiling; UPLC-MS/MS.; Antiviral; UPLC-MS/MS; SARS-COV-2; Psidium guajava.; مضاد فيروسات، المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS COV-2)، بسيديوم جوافة، التنميط المستقلب، الكروماتوغرافيا السائلة فائقة الأداء-قياس الطيف الكتلي الترادفي (UPLC-MS/MS). |
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Farmasi |
Depositing User: | Fadlli Syahmi |
Date Deposited: | 25 Apr 2024 14:40 |
Last Modified: | 25 Apr 2024 14:40 |
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/62945 |
Downloads
Downloads per month over past year
Actions (login required)
![]() |
View Item |