Analisa Hasil LC-MS Fermentasi Ekstrak Bekatul oleh Rhizopus oryzae Menggunakan Pendekatan Cheminformatika

ABSTRAK:

LC-MS merupakan suatu teknik analisa kimia yang digunakan dalam mendeteksi suatu kandungan dalam sampel kimia. LC-MS yang digunakan pada penelitian ini yaitu Waters XEVO dengan metode TQD. Hasil dari LC-MS memiliki resolusi yang rendah sulit untuk diidentifikasi tanpa menggunakan bantuan dari komputer. Tujuan penelitian ini adalah untuk memprediksi dan menginterpretasi hasil LC-MS dari fermentasi ekstrak bekatul oleh Rhizopus oryzae. Interpretasi hasil LC-MS dilakukan dengan melihat spektra dan menentukan pengelompokan senyawa. Data yang berupa gambar spektra diolah dengan software ImageJ untuk menentukan koordinat titik X dan Y sehingga dapat diketahui intensitas dan nilai m/z. Data spektra dari database diperlukan untuk dapat melihat kelompok senyawa pada sampel. Data spektra dari database dibuat menggunakan CFM-ID sehingga dapat diketahui nilai intensitas dan m/z. Nilai intensitas dan m/z akan digunakan dalam analisa metode PCA dengan memanfaatkan database. Hasil pengolahan data menggunakan PCA memiliki score 14,6% dengan PC1=7,4% dan PC2=7,2% dan menunjukkan pengelompokkan yang dibedakan dengan beberapa warna yang berbeda, yaitu merah (fenolik), biru (flavonoid), hijau (steroid), dan oranye (sakarida). Pengelompokkan berdasarkan volatilitas menunjukkan dugaan sampel 1,2,7,8 dan 9 berupa non-volatil dan 3,4,5, dan 6 berupa volatil dengan score PCA 43%. Berdasarkan score plot PCA, Sampel 1-8 berada pada daerah fenolik dan sampel 9 pada flavonoid. Berdasarkan perbandingan diduga sampel 1-8 memiliki 2 struktur benzena dengan jenis fenolik dan sampel 9 memiliki sturktur flavonoid

ABSTRACT:

LC-MS is a chemical analysis technique used to detect ingredients in chemical samples. The LC-MS used in this research is Waters XEVO with the TQD method. Low resolution LC-MS results are difficult to identify without using computer assistance. The aim of this research is to predict and interpret LC-MS results from fermentation of rice bran extract by Rhizopus oryzae. Interpretation of LC-MS results is done by looking at the spectra and determining compound groupings. The data in the form of spectral images is processed with ImageJ software to determine the coordinates of the X and Y points so that the intensity and m/z values can be determined. Spectra data from the database is needed to be able to see groups of compounds in the sample. Spectra data from the database is created using CFM-ID so that intensity and m/z values can be known. Intensity and m/z values will be used in the PCA method analysis using a database. The results of data processing using PCA have a score of 14.6% with PC1=7.4% and PC2=7.2% and show groupings that are differentiated by several different colors, namely red (phenolic), blue (flavonoid), green (steroid), and orange (saccharide). Grouping based on volatility shows that samples 1,2,7,8 and 9 are non-volatile and 3,4,5 and 6 are volatile with a PCA score of 43%. Based on the PCA score plot, Samples 1-8 are in the phenolic area and sample 9 is in flavonoid. Based on the comparison, it is suspected that samples 1-8 have 2 benzene structures with a phenolic type and sample 9 have flavonoid structure.

مستخلص البحث:

LC-MS هي تقنية تحليل كيميائي تستخدم للكشف عن المكونات في العينات الكيميائية. إن LC-MS المستخدم في هذا البحث هو Waters XEVO مع طريقة TQD. من الصعب تحديد نتائج LC-MS ذات الدقة المنخفضة دون استخدام مساعدة الكمبيوتر. الهدف من هذا البحث هو التنبؤ وتفسير نتائج LC-MS من تخمير مستخلص نخالة الأرز بواسطة الرَّازِبَةُ الرُّزِّيَّة. يتم تفسير نتائج LC-MS من خلال النظر في الأطياف وتحديد المجموعات المركبة. تتم معالجة البيانات على شكل صور طيفية باستخدام برنامج ImageJ لتحديد إحداثيات نقطتي X وY بحيث يمكن تحديد قيم الكثافة وm/z. هناك حاجة إلى بيانات الأطياف من قاعدة البيانات لتتمكن من رؤية مجموعات المركبات في العينة. يتم إنشاء بيانات الأطياف من قاعدة البيانات باستخدام CFM-ID بحيث يمكن معرفة قيم الكثافة وm/z. سيتم استخدام قيم الشدة وm/z في تحليل طريقة PCA باستخدام قاعدة البيانات. حصلت نتائج معالجة البيانات باستخدام PCA على درجة 14.6% مع =PC1 ٧,٤% و=PC2 ٧,٢% وتظهر المجموعات التي يتم تمييزها بعدة ألوان مختلفة، وهي الأحمر (الفينول)، والأزرق (الفلافونويد)، والأخضر (الستيرويد)، والبرتقال (السكاريد). يظهر التجميع على أساس التقلب أن العينات ١,٢,٧,٨و٩ غير متطايرة وأن ٣,٤,٥ و٦ متقلبة مع درجة PCA تبلغ ٤٣ ٪. استناداً إلى مؤامرة النتيجة PCA، العينات ١-٩ موجودة في المنطقة الفينولية. بناءً على المقارنة، من المتوقع أن العينات من ١ إلى ٩ تحتوي على تركيبتين بنزين من النوع الفينولي.