# NOPUBLISH 24/5/2023# Uji in silico aktivitas antikanker senyawa pada tanaman san//rego melalui penghambatan EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor)

INDONESIA:

Kanker adalah penyakit yang disebabkan ketika sel membelah tak terkendali dan menyebar ke jaringan sekitarnya. Pengembangan obat terus dilakukan dalam menangani penyakit kanker dengan efek samping yang minimal melalui penargetan berbagai protein. EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) merupakan salah satu protein target dalam terapi untuk menangani kanker. EGFR berperan dalam mengatur perkembangan jaringan epitel dan homeostasis yang jika terjadi overekspresi akan menyebabkan kanker. Senyawa pada tanaman sanrego (Lunasia amara) dilaporkan memiliki senyawa aktif yang berperan dalam penghambatan aktivitas kanker. Penelitian mempunyai tujuan dalam mengetahui potensi yang terdapat dalam senyawa pada tumbuhan sanrego (Lunasia amara) sebagai penghambat aktivitas EGFR (PDB ID 6V6O). Dalam penelitian ini dilakukan uji sifat fisikokimia berdasarkan aturan lima lipinski melalui SwissADME. Senyawa yang memenuhi aturan lima lipinski selanjutnya dilakukan uji molecular docking melalui aplikasi PyRx. Agar memastikan kondisi ligan yang sesuai dalam sistem dinamis maka dilakukan juga simulasi dinamika molekuler GROMACS melalui WebGro yang merupakan server web Simulasi Makromolekul oleh University of Arkansas for Medical Sciences (UAMS) SimLab. Didapatkan hasil bahwa binding affinity dari senyawa lunamarine dan lunine dengan reseptor EGFR (6v6o) memiliki nilai tertinggi, meskipun memiliki nilai yang lebih rendah dari ligan kontrol (imidazole). Hasil analisis pola interaksi residu asam amino yang berasal dari senyawa uji menunjukkan bahwa terdapat kesamaan dengan ligan asli yang terdapat pada binding site. Pada hasil simulasi dinamika
molekuler menunjukkan bahwa lunine memiliki interaksi dan konfromasi yang paling stabil dibandingkan senyawa tanaman sanrego lainnya dalam keadaan terhidrasi. Berdasarkan hasil analisis tersebut dapat diprediksi bahwa senyawa uji berpotensi dalam menghambat aktivitas reseptor EGFR (6V6O).

ENGLISH:

Cancers are disorders that cause cells to divide uncontrollably and spread to surrounding tissues. Drug improvement continues in most cancer treatments with minimal
side effects through a focus on multiple proteins. EGFR (Epidermal enhancement aspect receptor) is one of the target proteins in cancer therapy. EGFR plays a role in regulating epithelial tissue repair and homeostasis which, if overexpressed, can result in cancer. Compounds in the sanrego plant (Lunasia amara) are thought to have active compounds that play a role in inhibiting cancer activity. The purpose of the research was to test compounds in the sanrego plant (Lunasia amara) to inhibit EGFR activity (6V6O). On this observation, the physicochemical properties were checked according to the SwissADME five Lipinski rules of use. Compounds following lima lipinski guidelines were then subjected to molecular docking using PyRx. To ensure proper ligand requirements in moving forward, the molecular dynamics simulation of GROMACS is also achieved via WebGro which is a Macromolecular Simulation web server with UAMS SimLab. It was found that the binding affinity of lunamarine and lunine compounds with the EGFR receptor (6v6o) has a higher cost compared to the other test compounds, although it has a lower cost than the manipulation ligand (imidazole). As a result, evaluation of the relationship between the final amino acids of the check compounds indicated their similarity with the derived ligands located at the active site of the receptor. The effects of molecular dynamics simulations show that lunin has the most stable dating and formation compared to other sanrego compounds in the hydrated state. based on the results of a holistic assessment, it can be anticipated that the compounds examined have the ability to impair the activity of the EGFR (6V6O) receptor.

ARABIC

السرطان هو مرض يحدث عندما تنقسم الخلايا بشكل لا يمكن السيطرة عليه وتنتشر إلى الأنسجة المحيطة. يستمر Epidermal ( EGFR . تطوير الأدوية في علاج السرطان بأقل آثار جانبية من خلال استهداف البروتينات المختلفة دورا في تنظيم نمو EGFR هوأحد البروتينات المستهدفة في علاج السرطان. يلعب Growth (Factor Receptor
الأنسجة الظهارية والتوازن الذي إذا حدث الإفراط في التعبير سيسبب السرطان. تم الإبلاغ عن المركبات في نباتات لوجود مركبات نشطة تلعب دورا في تثبيط نشاط السرطان. يهدف البحث إلى تحديد )Lunasia amara( سانريغو في هذه الدراسة .EGFR )6V6O( كمثبطات لنشاط )Lunasia amara( إمكانات المركبات في نباتات سانريغو
ثم تخضع .SwissADME ، تم اختبار الخصائص الفيزيائية والكيميائية بناء على قانون خمسة ليبينسكي باستخدام من أجل ضمان ظروف الرباط المناسبة .PyRx المركبات التي تفي بقانون خمسة ليبينسكي للالتحام الجزيئي باستخدام وهو خادم WebGro الجزيئية أيضا من خلال GROMACS في النظام الديناميكي ، تم إجراء محاكاة ديناميكيات وجد أن ارتباط التقار ب .)UAMS( SimLab ويب للمحاكاة الجزيئية الكبيرة بواسطة جامعة أرك نساس للعلوم الطبية
له قيمة أفضل مقارنة بمركبات (PDB ID 6V6O)EGFR مع مستقبلات lunine و lunamarine لمركبات
الاختبار الأخرى ، على الرغم من أن له قيمة أقل من ليجند التحكم )إيميدازول(. تظه نتائج تحليل التفاعل لبقايا
الأحماض الأمينية من مركب الاختبار أن هناك أوجه تشابه مع الرباط الأصلي الموجود على الجانب النشط من
المستقبل. تظهر نتائج محاكاة الديناميات الجزيئية أن اللونين لديه التفاعل والتكوين الأكثر استقرارا مقارنة بمركبات
نبات سانريغو الأخرى في حالة الماء. بناء على نتائج التحليل ، يمكن التنبؤ بأن مركب الاختبار لديه القدرة على تثبي