Analisis Citra Ginjal untuk identifikasi Sel Piknosis dan Nekrosis

ABSTRAK

Ginjal adalah organ ekskresi dalam vertebrata yang berbentuk mirip kacang. Sebagai bagian dari sistem urin, ginjal berfungsi menyaring kotoran (terutama urea) dari darah dan membuangnya bersama dengan air dalam bentuk urin. Seperti halnya hati, ginjal juga rawan terhadap zat-zat kimia. Oleh karena itu, zat kimia yang terlalu banyak berada di dalam ginjal diduga akan mengakibatkan kerusakan sel, seperti piknosis dan Nekrosis.

Piknosis atau pengerutan inti merupakan homogenisasi sitoplasma dan peningkatan eosinofil. Sedangkan Nekrosis merupakan kematian sel jaringan akibat jejas saat individu masih hidup. Pada penelitian di bidang biologi, dalam menentukan sil piknosis dan nekrosis umumnya mereka masih mengira-ngira dan masih menggunakan perhitungan secara manual sehingga data yang dihasilkan memiliki nilai eror yang relatif tinggi, karena sangat tipisnya perbedaan dari ciri sel-sel tersebut dan perbedaan persepsi setiap orang dalam melihat dan menghitung jumlah sel piknosis dan nekrosis. Untuk mengatasi hal tersebut diperlukan suatu pemikiran serta inovasi teknologi praktis tepat guna untuk mempermudah dalam penghitungan sel-sel tersebut. Sesuai Firman Allah SWT dalam Al-Qur’an Surat Al-Jatsiyah ayat 13. Berdasarkan latar belakang tersebut penelitian dilakukan dengan tujuan: (1) Mencari nilai threshold yang tepat untuk identifikasi sel piknosis dan nekrosis. (2) Mencari ketepatan program aplikasi yang digunakan dalam penghitungan jumlah sel.

Penelitian ini menggunakan metode eksperimental dalam bentuk pengolahan citra digital, dimana objek penelitiannya berupa citra digital. Pengolahan citra dilakukan dengan mengubah warna citra menjadi grayscale dan selanjutnya menapis citra menggunakan filter Gaussian dan dilanjutkan dengan mencari nilai threshold yang tepat untuk menentukan ciri dari masing-masing sel piknosis dan nekrosis.

Nilai threshold yang didapatkan dari penelitian ini yaitu 0.66, 0.67, 0.68. Nilai yang paling tepat untuk mencirikan sel piknosis dan nekrosis adalah nilai threshold 0.67, selanjutnya citra hasil threshold ditest dengan aplikasi penghitungan sel dan mendapatkan hasil yang cukup memuaskan yaitu dengan nilai KR (Kesalahan Relatif) masing-masing sel (sel piknosis dan sel nekrosis) adalah 8.5% dan 9%.

ABSTRACT

Kidneys are organs of excretion in vertebrates which have a shap like a peanut. As part of the urinary system, the function of kidney filter wastes (especially urea) from the blood and threw it together with water in the form of urine. Like heart, kidneys are also vulnerable to the chemicals. Therefore, chemicals that are many staying in the kidney are supposed to make cell in damage, for exemple piknosis and necrosis.

Piknosis or shrinkage of the core of cell is homogenized of the cytoplasm and increased eosinophils. Necrosis the death of the tissue of cells due to injury when the single cell is still alive. Meanwhile research of biology, in determining necrosis and piknosis cell, those are generally still the counting and using manual calculations so that the resulting data have relatively high error values, because of the very thin difference of the characteristics of the cells and the differences in perceptions of each person in view and the calculate the number of necrosis cells and piknosis cell. To overcome this we need a thoughtful and practical innovation of appropriate technologies to facilitate the calculation of such cells. As the Word of Allah in the Qur'an Surat Al-Jaatsiyah ayat 13.

Based on background of research is conducted for the purpose: (1) Finding an appropriate threshold value for identification of piknosis cell and of necrosis cell. (2) Looking for the accuracy of the application programs that are used in calculating of cells.

This research uses experimental methods in the form of digital processing image, where the object of this research in the form of a digital image. Processing image is done by changing the color of image into grayscale and then dismissed the image by using a Gaussian filter and proceed by finding the appropriate threshold values to determine the characteristics of each piknosis cell and necrosis cell.

Threshold values obtained from this study are 0.66, 0.67, 0.68. The most appropriate threshold of piknosis cells and necrosis is 0.67, then the image of the threshold tested by using the calcutaling cell counting applications and is obtained satisfactory results with the values of KR (Relative Error) of each cell (piknosis cells and necrosis cell) are 8.5% and 9%.