Uji aktivitas antibakteri ekstrak etanol biji alpukat (Persea americana Mill.) secara In Silico dan pengaruhnya terhadap jumlah sel fibroblas jaringan kulit mencit (Mus musculus) yang diinfeksi Staphylococcus aureus

ABSTRAK

Infeksi nosokomial menjadi penyebab 1,4 juta kematian setiap hari di dunia. Data International Nosocomial Infection Control Consortium menunjukkan 84,4% infeksi nosokomial disebabkan oleh S. aureus yang dapat menimbulkan penyakit kulit. Biji P. americana diketahui berpotensi sebagai antibakteri dan digunakan dalam studi dermatologi. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui potensi aktivitas antibakteri ektrak etanol biji P. americana secara in silico dan pengaruhnya terhadap jumlah sel fibroblas pada jaringan kulit mencit yang diinfeksi S. aureus.

Penelitian ini bersifat komputasi dan eksperimental. Uji in silico menggunakan metode molecular docking dengan software PyRx antara PBP2a (reseptor) dan senyawa aktif biji P. americana sebagai ligan. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan 5 perlakuan dan 5 ulangan dengan kontrol positif hefixim. Sebanyak 25 ekor mencit dibagi dalam 5 perlakuan yaitu normal (tanpa injeksi bakteri, tanpa terapi), K+ (injeksi bakteri, terapi helixim dosis 200 mg/kgBB), P0 (injeksi bakteri, dosis terapi 0 mg/kgBB), P1 (terapi ekstrak dosis 600 mg/kgBB), P2 (terapi ekstrak dosis 1200 mg/kgBB). Pengamatan jumlah sel fibroblas dilakukan dengan mikroskop perbesaran 400x sebanyak 5 lapang pandang. Analisis jumlah sel fibroblas menggunakan uji Kolmogorov-Smirnov, uji Welch dan uji Games-Howell.

Hasil uji in silico menunjukkan bahwa senyawa rutin dalam ekstrak etanol biji P. americana memiliki potensi terbaik untuk berikatan dengan PBP2a (∆G=-18,2 kkal/mol). Berdasarkan hasil analisis uji Welch pemberian ekstrak etanol biji P. americana mempengaruhi jumlah sel fibroblas (p=0,000). Dengan demikian, senyawa aktif dalam biji P. americana dapat direkomendasikan sebagai obat antibakteri dan dapat meningkatkan jumlah sel fibroblas akibat infeksi S. aureus.

ABSTRACT

Nosocomial infection causes 1,4 million mortality every day in a world. International Nosocomial Infection Control Consortium (INICC) data shows that 84,4% nosocomial infection caused by S. aureus that can cause skin infection. Avocado (P. americana) seed has been reported as antibacterial agent and used for dermatological applications. This research was aimed to know the potency of antibacterial activity of ethanolic extract of P. americana seed in in silico study and the effect on fibroblast cells of mice’s skin tissue infected by S. aureus.

This research is computational and experimental study. In silico test using molecular docking method with PyRx software between PBP2a as receptor and phytochemical compounds in P. americana seed as ligand. This research uses Completely Randomized Design (CRD) with 5 treatments and 5 replications and helixim as positive control. 25 mice are separated in 5 treatments are, normal (without injection and therapy), K+ (injection, helixim therapy at dose 200 mg/kgBB), P0 (injection and extract therapy at dose 0 mg/kgBB), P1 (extract therapy at dose 600 mg/kgBB), P2 (extract therapy at dose 1200 mg/kgBB). Observing the number of fibroblast cells was done by microscope on 5 fields of views with magnification 400x. Data were analyzed by SPSS 16.00 for windows with normality test using Kolmogorov-Smirnov test, homogeneity test using Welch test dan post hoc test using Games-Howell test.

The result showed that rutin compound has the best potency to bind PBP2a (binding affinity: -18,2 kkal/mol). Based on Welch test, the therapy of ethanolic extract of P. americana seed influences the number of fibroblast cells (p=0,000). Thus, phytochemical active compounds in P. americana seed can be recommended as antibacterial drug and can increase the number of fibroblast cells that caused by S. aureus.

ملخص البحث

يسبب العدوى نوسوكوميال إلى 1.4 مليون وفاتكل يوم فى العالم. وأظهرت البيانات International Nosocomial Infection Control Consortium 84.4٪ العدوى نوسوكوميال منS. aureus الذى يمكن أن يسبب الأمراض الجلدية. أن بذور الأفوكادو(P. americana)يعرف الإمكانباعتباره مضاد للجراثيم ويستخدم في دراسات الأمراض الجلدية. وقد أجريت هذه الدراسة لتحديد إمكانية النشاط المضاد للبكتيريا الاستخراج الإيثانول من البذور الأفوكادو (Persea ameicana Mill) من خلال السيليكو In Silicoوتأثيره على إجمالي الخلايا الليفية الشبكة الجلد من الفئران (Mus musculus) المصاب Staphylococcus aureus.

هذه الدراسة الحسابية والتجريبية. استخدم اختبار سيليكو طريقة molecular dockingمع برنامج PyRx بينPBP2a(reseptor) والمركب النشط البذور الأفوكادو(P. americana) كما يجند. استخدمت هذه الدراسة تصميم عشوائي تماما (RAL) مع 5 علاجات و 5 مكررات مع السيطرة الإيجابية على هيفكسيم. تم تقسيم ما مجموعه 25 الفئران إلى خمس العلاج التى أمر طبيعي (بدون حقن البكتيريا، من دون علاجK + (حقن البكتيريا)، والعلاجهيفكسيمجرعة 200 ملغ / كلغ ب ب) P0 (حقن البكتيريا، الجرعات العلاجية من 0 ملغ / كلغ ب ب، P1 (العلاجية الاستخراج جرعة 600 ملغ / كلغ ب ب)، P2 (العلاج استخراج جرعة 1200 ملغ / كغ ب ب). تمت مراقبة عدد الخلايا الليفية مع مجهر التكبير 400xبقدر 5 مجال الرؤية. تحليل عدد الخلايا الليفية يعنى باستخدام اختبار Kolmogorov-Smirnov، اختبار Welch و Games-Howell.

نتائج اختبارسيلوكوظهرت مركب روتين في استخراج الإيثانول من البذور الأفوكادو(P. americana) لديها أفضل فرصة لربطPBP2a (∆G=-18,2 kkal/mol).استنادا إلى تحليل Welchالإعطاء الاستخراج الإيثانول من بذور الأفوكادو(P. Americana) يؤثر على عدد الخلايا الليفية(p = 0.000).وبالتالي، يمكن أن يوصي المركب النشط في بذور الأفوكادو(P. americana )كعامل مضاد للبكتيريا ويمكن أن يزيد من عدد الخلايا الليفية بسبب عدوىS. Aureus.