Analisis Senyawa Chlorogenic Acid (CGA) Kopi secara in silico sebagai Kandidat Agen Kompetitif Inhibitor oxLDL Dalam Berikatan dengan SRA dan P-Selektin

INDONESIA:

Aterosklerosis merupakan proses patologis kompleks yang mengacu pada pembentukan plak ateroma pada lumen pembuluh darah. Jika terjadi aterosklerosis di pembuluh koroner maka akan terjadi Penyakit Jantung Koroner (PJK) yang merupakan penyakit yang paling mematikan di dunia.

Data WHO menyatakan, dari 17,3 juta kematian akibat penyakit jantung, serangan jantung bertanggung jawab untuk 7,3 juta kematian dan stroke bertanggung jawab untuk 6,2 juta kematian.

Sedangkan prevalensi penyakit jantung di Indonesia 0,5% yang terdiagnosis dokter dan nilai ini jauh meningkat pada kasus yang tidak terdiagnosis.

Penelitian ini adalah studi pendahuluan yang ingin mengeksplorisasi pengaruh dari CGA dalam menghambat aterosklerosis yang belum diteliti sebelumnya.

Oleh karena itu, dengan penelitian ini diharapkan dapat mengetahui potensi CGA dalam menghambat terjadinya aktivasi endotel, terbentuknya sel busa dan juga diprediksi sebagai
ligand kompetitif oxLDL bagi reseptor P-Selectin dan SRA.

Desain penelitian ini adalah deskriptif eksploratif, dimana penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bagaimana potensi senyawa aktif kopi yaitu CGA sebagai agen kandidat aterosklerosis secara in silico.

Hasil Nilai Binding affinity antara ligan dengan reseptor dapat dinilai menggunakan Molecular Docking. Uji Molecular
Docking bertujuan untuk mempredikasi energi ikatan yang terbentuk diantara duatau lebih molekul.

Berdasarkan hasil uji Molecular Docking pada senyawa CGA didapatkan nilai binding affinity yang bermacam-macam pada setiap modelnya.

Ikatan yang terbentuk antara ligan dan reseptor akan semakin stabil sehingga dapat membentuk ikatan yang semakin kuat ditandai dengan nilai binding affinity yang semakin negatif, sehingga semakin kecil nilai ikatan energinya, maka semakin besar daya hambat yang dihasilkan Berdasarkan penjelasan diatas menunjukkan bahwa ikatan antara CGA dengan P-Selektin dan SRA memiliki nilai binding affinity terendah yaitu pada model 0 dan dapat disimpulkan sebagai model CGA paling tepat dalam berikatan dengan reseptor P-Selektin dan SRA.

Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa senyawa CGA pada kopi (coffea sp) dapat berikatan dengan P-Selektin dan SRA sebagai ligan dan reseptor dalam menghambat aterosklerosis secara In Silico.

Potensi CGA dapat menjadi ligand kompetitif oxLDL bagi P-selektin dan SRA dengan mengetahui hasil skor bioaktif, profil mekanisme kerja dan nilai afinitas ikatan.

Afinitas ikatan rerata senyawa CGA terhadap SRA dan P-Selektin yang didapatkan dari uji
docking adalah -5,8 dan -6,3.

ENGLISH:

Atherosclerosis is a complex pathological process that refers to the formation of atheromatous plaques in the lumen of blood vessels. If there is atherosclerosis in the coronary arteries, coronary heart disease (CHD) will occur, the deadliest disease in the world.

WHO data states that out of 17.3 million deaths from heart disease, heart attacks are responsible for 7.3 million deaths, and strokes are responsible for 6.2 million deaths.

Meanwhile, the prevalence of heart disease in Indonesia is
0.5% diagnosed by a doctor, and this value is much higher in undiagnosed cases. This research is a preliminary study exploring the effect of CGA in inhibiting atherosclerosis which has not been studied previously.

Therefore, this research is expected to determine the potential of CGA in inhibiting endothelial activation and foam cell formation and also predict it as a competitive oxLDL ligand for P-Selectin and SRA receptors.

The design of this research is descriptive and exploratory.
This study aims to determine how the potential of the active compound of coffee, namely CGA as a candidate agent for atherosclerosis in silico.

Results The value of the binding affinity between the
ligand and the receptor can be assessed using Molecular Docking.

The molecular Docking Test aims to predict the bond energy formed between two or more molecules.

Based on the results of the Molecular Docking test on CGA compounds, various binding affinity values were obtained in each model.

The bond formed between the ligand and the receptor will be more stable so that it can form a stronger bond characterized by a more negative binding affinity value, so the smaller the bond energy value, the greater the inhibitory power produced.

P-Selectin and SRA have the lowest binding affinity value, namely in model 0, and can be concluded as the most appropriate CGA model in binding to P-Selectin and SRA receptors.

Based on the results of the study, it can be concluded that the CGA compound in coffee (Coffea sp) can bind to P-Selectin and SRA as a ligand and receptor
in inhibiting atherosclerosis in Silico.

Potential CGA can be a competitive oxLDL ligand for P-selectin and SRA by knowing the results of the bioactive score, the profile of the mechanism of action, and the value of the binding affinity.

The average binding affinity of CGA compounds to SRA and P-Selectin obtained from the docking test was -5.8 and -6.3.