Afifah, Nur (2022) NO PUBLISH Prediksi aktivitas antihipertensi senyawa ekstrak etanol 96% herba serai (cymbopogon citratus) terhadap angiotensin ii receptor (4ZUD) dan β-adrenergic receptor (6PS5) secara in silico. Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
This is the latest version of this item.
Text (Fulltext)
18930052.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only until 4 July 2024. Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (3MB) | Request a copy |
Abstract
INDONESIA:
Hipertensi diartikan sebagai gangguan sistem peredaran darah yang menyebabkan tekanan darah sistolik ≥140 mmHg dan tekanan darah diastolik ≥90 mmHg. Hipertensi terjadi karena beberapa mekanisme. Salah satunya adalah aktivasi dari reseptor angiotensin II dan β-adrenergik. Herba Serai (Cymbopogon citratus) memiliki aktivitas menghambat konversi angiotensin I menjadi angiotensin II pada penelitian sebelumnya. Tujuan dilakukannya penelitian ini untuk memprediksi aktivitas antihipertensi C. citratus melalui mekanisme yang berbeda, yaitu melalui penghambatan aktivasi angiotensin II (ID 4ZUD) dan penghambatan aktivasi β-adrenergik (ID 6PS5). Senyawa hasil metabolite profiling
UPLC-QToF MS/MS ekstrak etanol 96% herba C. citratus dipreparasi menggunakan ChemDraw Ultra 12.0. Optimasi geometri menggunakan Avogadro 1.0.1, kemudian dilakukan molecular docking denga Autodock Vina (PyRx 0.8). Visualisasi hasil docking dilakukan dengan Biovia Discovery Studio 2021 untuk mencari interaksi antagonis terhadap angiotensin II dan β-adrenergik. Senyawa dianalisis sifat fisikokimia dengan SwissADME dan diprediksi toksisitas
menggunakan Protox II online tools. Penambatan dikatakan valid dan aplikasi tersebut dapat digunakan karena RMSD <2 Å. Hasil studi in silico menunjukkan dari 37 senyawa hasil metabolite profiling terdapat 5 senyawa yang mempunyai
kemiripan ikatan asam amino, jarak farmakofor dan binding affinity dengan native ligand Olmesartan, diprediksi antagonis 4ZUD dan 4 senyawa mempunyai kemiripan dengan 1-(isopropylamino)-3-(1-naphthyloxy)-2-propanol diprediksi
suatu antagonis 6PS5 yang berefek antihipertensi. Sehingga ekstrak etanol 96% herba C. citratus diprediksi memiliki potensi sebagai antihipertensi.
ENGLISH:
Hypertension is defined as a circulatory system disorder that causes systolic blood pressure of ≥140 mmHg and diastolic blood pressure of ≥90 mmHg. Hypertension occurs due to several mechanisms. One of them is the activation of angiotensin II and -adrenergic receptors. Herba Serai (Cymbopogon citratus) has the activity of inhibiting the conversion of angiotensin I to angiotensin II in a previous study. This study aimed to predict the antihypertensive activity of C. citratus through different mechanisms, namely through inhibition of angiotensin II activation (ID 4ZUD) and inhibition of β-adrenergic activation (ID 6PS5). The metabolite profiling compound UPLC-QToF MS/MS 96% ethanol extract of C. citratus herbs was prepared using ChemDraw Ultra 12.0. Geometry optimization using Avogadro 1.0.1, then molecular docking with Autodock Vina (PyRx 0.8). Visualization of docking results was carried out with Biovia Discovery Studio 2021 to look for antagonistic interactions with angiotensin II and β-adrenergic. The compounds were analyzed for physicochemical properties with SwissADME and tested for toxicity using Protox II online tools. The tethering is valid, and the application can be used because of RMSD <2 Å. The results of the in silico study showed that of the 37 compounds resulting from the metabolite profiling, five compounds had similar amino acid bonds, pharmacophore distance, and binding affinity with native ligand Olmesartan, predicted 4ZUD antagonists, and four compounds had similarities with 1-(isopropylamine)-3-(1 -naphthyloxy)-2-propanol is predicted to be a 6PS5 antagonist with antihypertensive effect. So, 96% ethanol extract of C. citratus herbs is predicted to have potential as an antihypertensive.
ARABIC:
يُعرَّف فرط ضغط الدم بأنه اضطراب في الدورة الدموية يسبب ضغط الدم الانقباضي ≥ 140 مليمتر من الزئبق وضغط الدم الانبساطي 90 مليمتر من الزئبق. يحدث فرط ضغط الدم بسبب بعض الآليات. واحد منهم هو تنشيط مستقبل الأنجيوتنسين 2 و β-الأدرينالية. عشبة الليمون (Cymbopogon citratus) لها نشاط في تثبيط تحويل أنجيوتنسين 1 إلى أنجيوتنسين 2 في الدراسة السابقة. الهدف من هذا البحث هو لنبوء نشاط الخافضة لضغط الدمC. citratus من خلال آليات مختلفة أي من خلال تثبيط تنشيط أنجيوتنسين 2 (معرف 4ZUD) وتثبيط تنشيط β-الأدرينالية (معرف 6PS5).تم تحضير المركبات الناتجة عن التنميط المستقلب UPLC-QToF MS/MS من استخلاص الإيثانول 96٪ عشبة C. citratus باستخدام تطبيق ChemDraw Ultra 12.0. تحسين الهندسة باستخدام تطبيق Avogadro 1.0.1 ، ثم الإرساء الجزيئي باستخدام طريقة Autodock Vina (PyRx 0.8). وتصور الإرساء باستخدام Biovia Discovery Studio 2021 للبحث عن التفاعلات المضادة مع الأنجيوتنسين 2 ومستقبل β-الأدرينالية. تحلل المركبات من أجل الخصائص الفيزيائية والكيميائية باستخدام SwissADME واختبار السمية باستخدام أدوات بوتكس الثاني عبر الإنترنت. يُقال إن الربط صالح ويستطيع استخدام التطبيق لأن RMSD < 2 Å. أظهرت نتائج دراسة السيلكون أن من بين 37 مركبًا ناتجة عن التنميط المستقلب ، كان هناك خمسة مركبات لها تشابه روابط الأحماض الأمينية ، ومسافة الدوائية وتقارب الارتباط بمركب أولميسارتان الأصلي ، تم توقع بمضاد 4ZUD و أربعة مركبات لها تشابه مع 1-(isopropylamino)-3-(1-naphthyloxy)-2-propanol تنبأ بمضاد PS56 له تأثير الخافضة لضغط الدم. لذلك من المتوقع أن يكون لاستخلاص الإيثانول 96٪ عشبة C. citratus إمكانات كالخافضة لضغط الدم.
Item Type: | Thesis (Undergraduate) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Supervisor: | Ma'arif Z. A., Burhan and Dianti, Meilina Ratna | |||||||||
Contributors: |
|
|||||||||
Keywords: | C. citratus; antihipertensi; molecular docking; 4ZUD; 6PS5 C. citratus; antihypertensive; molecular docking; 4ZUD; 6PS5 C. citratus ; الخافضة لضغط الدم ; الإرساء الجزيئي ; ZUD4 ; 6PS5 | |||||||||
Subjects: | 03 CHEMICAL SCIENCES > 0303 Macromolecular and Materials Chemistry > 030307 Theory and Design of Materials 03 CHEMICAL SCIENCES > 0307 Theoretical and Computational Chemistry > 030799 Theoretical and Computational Chemistry not elsewhere classified 10 TECHNOLOGY > 1004 Medical Biotechnology > 100403 Medical Molecular Engineering of Nucleic Acids and Proteins |
|||||||||
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Farmasi | |||||||||
Depositing User: | Nur Afifah | |||||||||
Date Deposited: | 27 Aug 2024 11:04 | |||||||||
Last Modified: | 27 Aug 2024 11:04 | |||||||||
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/38379 |
Downloads
Downloads per month over past year
Available Versions of this Item
Actions (login required)
View Item |