Rosalind, Sela Ardhisa (2022) NO PUBLISH Prediksi aktivitas diuretik senyawa ekstrak etanol 96% herba serai (cymbopogon citratus ) terhadap reseptor carbonic anhydrase ii(1Z9Y) secara in silico. Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
Text (Fulltext)
18930075.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only until 6 July 2024. Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (3MB) | Request a copy |
Abstract
ABSTRAK:
Diuretik berperan penting dalam farmakologi dan pilihan pengobatan kondisi penyakit edematous dan non-edematous. Sediaan diuretikum dapat digunakan pada beberapa kasus klinis seperti sirosis hati, gagal jantung, hipertensi, asites dll. Penggunaannya salah satu obat dalam golongan diuretik yaitu furosemid dengan jangka waktu yang panjang dapat menyebabkan ketidakseimbangan elektrolit sekunder,
perubahan metabolisme, maturity onset diabetes, aktivasi renin-angiotensi dan neuroendokrin sistem, ototoksisitas serta masalah seksual. Tujuan dilakukannya penelitian
ini untuk memprediksi aktivitas diuretik Ekstrak Etanol 96% Herba Serai (Cymbopogon citratus ) melalui mekanisme yang berbeda, yaitu melalui penghambatan aktivasi Carbonic anhydrase II (CA II) (ID 1Z9Y). Senyawa hasil metabolite profiling UPLC-QToF MS/MS ekstrak etanol 96% Herba Serai (Cymbopogon citratus ) dipreparasi menggunakan
ChemDraw Ultra 12.0. Optimasi geometri menggunakan Avogadro 1.0.1, kemudian dilakukan molecular docking denga Autodock Vina (PyRx 0.8). Visualisasi hasil docking dilakukan dengan Biovia Discovery Studio 2021 untuk mencari interaksi antinhbitor terhadap CA II. Senyawa dianalisis sifat fisikokimia dengan SwissADME dan diuji toksisitas menggunakan Protox II online tools. Penambatan dikatakan valid dan aplikasi tersebut dapat digunakan apabila nilai RMSD < 2 Å. Hasil studi in silico menunjukkan dari 37 senyawa hasil metabolite profiling terdapat 2 senyawa yang mempunyai kemiripan jarak farmakofor dan ikatan asam amino dengan native ligand Furosemide, dan diprediksi memiliki potensi sebagai Inhibitor 1Z9Y. Sehingga ekstrak etanol 96% herba Cybopogon citratus diprediksi memiliki potensi sebagai diuretik.
ABSTRACT:
Diuretics play an important role in pharmacology and treatment options for edematous and non-edematous disease conditions. Diuretic preparations can be used in some clinical cases such as cirrhosis of the liver, heart failure, hypertension, ascites, etc. The use of one of the drugs in the diuretic group, namely furosemid for a long period of time can cause secondary electrolyte imbalances, metabolic changes, maturity onset of diabetes, activation of renin-angiotension and neuroendocrine systems, muscularoxiity and sexual problems. The purpose of this study was to predict the diuretic activity of Ethanol Extract of 96% Lemongrass Herb (Cymbopogon citratus ) through a different mechanism, namely through inhibition of activation of Carbonic Anhydrase II (CA II) (ID 1Z9Y). The metabolite profiling compound UPLC-QToF MS/MS ethanol extract 96% Herba Lemongrass (Cymbopogon citratus ) was prepared using ChemDraw Ultra 12.0. Geometry optimization using Avogadro 1.0.1, then molecular docking with Autodock Vina (PyRx 0.8). Visualization of docking results was done with Biovia Discovery Studio 2021 to look for inhibition interactions with CA II. The compound analyzed its physicochemical properties with SwissADME and tested for toxicity using Protox II online tools. The tethering is said to be valid and the application can be used if the RMSD value < 2 Å. The results of the in silico study showed that of the 37 metabolite profiling compounds, there were 2 compounds that had similar pharmacophore distances and amino acid bonds with native ligand Furosemide, and were predicted to have the potential to be 1Z9Y Inhibitors. So that ethanol extract 96% of the herb C. citratus is predicted to have potential as a diuretic.
مستخلص البحث:
إن لمدر البول دور مهم في علم الأدوية واختيار علاج حالات الأمراض الوَذْمية وغير الوذمية. يمكن استخدام مستحضرات المدرة للبول في العديد من الحالات السريرية مثل تليف الكبد وفشل القلب وارتفاع ضغط الدم والاستسقاء وما إلى ذلك. استخدام أحد الأدوية في فئة مدرة للبول، تعني الفوروسيميد لفترة طويلة سيؤدي إلى اختلال توازن المنحل بالكهرباء الثانوي، والتغيرات الأيضية، ومرض السكري بداية النضج، وتنشيط أنظمة الرينين-أنجيوتنسين والغدد الصماء العصبية، والسمية البصرية والمشاكل الجنسية. يهدف هذا البحث إلى التوقع بنشاط المدرة للبول لمستخلص الإيثانول 96٪ من Cymbopogon citratus من خلال آلية مختلفة ، أي من خلال تثبيط تنشيط الأنهيدراز الكربوني II (CA II) (ID 1Z9Y). تم تحضير مركب التنميط الأيضUPLC-QToF MS/MS من مستخلص الإيثانول 96%من عشب حشيشة الليمون Cymbopogon citratus باستخدام ChemDraw Ultra 12.0 أما تحسين الهندسة فباستخدام Avogadro 1.0.1 ، ثم أجري الالتحام الجزيئي مع Autodock Vina (PyRx 0.8). أما تنفيذ تصور نتائج الالتحام فبـ Biovia Discovery Studio 2021 للبحث عن تفاعلات معادية مع CA II. تم تحليل المركبات لمعرفة الخصائص الفيزيائية والكيميائية باستخدام SwissADME واختبارها للتأكد من سميتها باستخدام أدوات Protox II عبر الإنترنت. يقال إن الربط صالح بحيث يمكن استخدام ذاك التطبيق إذا كانت قيمة RMSD أقل من 2. أظهرت نتائج البحث في سيليكو أنه من بين 37 مركبا ناتجا عن تنميط الأيض هناك مركبان لهما مسافات دوائية مماثلة وروابط حمض أميني مع الليغاند الأصلي فوروسيميد، ومن المتوقع أن يكون لهما إمكانات كمثبطات 1Z9Y. حيث من المتوقع أن يكون لمستخلص الإيثانول بنسبة 96٪ من أعشاب C. citratus إمكانات كمدر للبول.
Item Type: | Thesis (Undergraduate) | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Supervisor: | Maimunah, Siti and Dianti, Meilina Ratna and Dharma, Tanaya Jati | ||||||||||||
Contributors: |
|
||||||||||||
Keywords: | Herba serai; Cymbopogon citratus; diuretik; in silico; 1Z9Y; furosemide Herba lemongrass; Cymbopogon citratus ; diuretic; in silico; 1Z9Y; furosemide. عشب حشيشة الليمون; سيمبوبوجون سيتراتوس، مدر للبول; في سيليكو;1Z9Y; فوروسيميد | ||||||||||||
Subjects: | 10 TECHNOLOGY > 1004 Medical Biotechnology > 100403 Medical Molecular Engineering of Nucleic Acids and Proteins | ||||||||||||
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Farmasi | ||||||||||||
Depositing User: | sela ardhisa rosalind | ||||||||||||
Date Deposited: | 27 Aug 2024 13:13 | ||||||||||||
Last Modified: | 27 Aug 2024 13:13 | ||||||||||||
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/38090 |
Downloads
Downloads per month over past year
Actions (login required)
View Item |