#NOPUBLISH 5/7/2022# Prediksi aktivitas antikolesterolemia senyawa ekstrak etanol 96% herba serai (Cymbopogon citratus) terhadap reseptor HMG CoA reductase (1HW9) secara in silico

INDONESIA:

Kolesterol merupakan salah satu unsur penting dalam tubuh dalam mengatur proses kimia, namun kadar kolesterol yang berlebihan berpotensi menyebabkan hiperkolesterolemia. Salah satu obat yang digunakan dalam terapi hiperkolesterolemia adalah antikolesterolemia. Penggunaan antikolesterolemia dalam jangka panjang memiliki efek samping sehingga diperlukan inovasi dalam pencarian obat alternatif menggunakan tanaman obat. Salah satu tanaman obat yang berpotensi sebagai antikolesterolemia yaitu serai (Cymbopogon citratus). Tujuan penelitian ini untuk memprediksi aktivitas senyawa antikolesterolemia pada hasil metabolite profiling ekstrak etanol 96% herba serai (Cymbopogon citratus) metode UPLC-QToF MS/MS terhadap reseptor HMG CoA Reductase (1HW9). Senyawa tersebut dianalisis sifat fisikokimia dengan SwissADME dan toksisitas menggunakan Protox Online Tools. Didapatkan 19 senyawa hasil metabolite profiling memenuhi aturan sifat fisikokimia yang baik dan tidak toksik. Senyawa terpilih tersebut selanjutnya dipreparasi menggunakan ChemDraw Ultra, lalu dioptimasi geometri dengan Avogadro. Kemudian dilakukan Molecular docking dengan PyRx. Visualisasi hasil Molecular docking dilakukan dengan Biovia Discovery Studio untuk mencari interaksi antagonis terhadap native ligand Simvastatin. Penambatan dikatakan valid dan software tersebut dapat digunakan apabila nilai RMSD < 2Å. Analisis secara in silico terhadap protein 1HW9 menunjukkan terdapat tiga senyawa yang memberikan interaksi antagonis dengan kemiripan nilai binding affinity, jarak farmakofor, dan jenis ikatan asam amino. Senyawa Butylated hydroxytoluene, Hexylresorcinol, dan Bis[4-(diethylamino)phenyl] methanone merupakan senyawa yang diprediksi memiliki potensi paling baik sebagai antikolesterolemia karena memiliki kemiripan parameter docking dengan Native Ligand Simvastatin. Oleh karena itu, senyawa ekstrak etanol 96% herba serai (Cymbopogon citratus) diprediksi memiliki aktivitas antikolesterolemia dengan mekanisme penghambatan aktivasi reseptor HMG CoA Reductase.

ENGLISH:

Cholesterol is one of the important elements in the body in regulating chemical processes, but excessive cholesterol levels cause hypercholesterolemia. One of the drugs used in the treatment of hypercholesterolemia is anticholesterolemia. The use of anticholesterolemia in the long term has side effects so that innovation is needed in the search for alternative medicines using medicinal plants. One of the medicinal plants that may be anticholesterolemic is lemongrass (Cymbopogon citratus). The purpose of this study was to predict the activity of anticholesterolemic compounds in the metabolite profiling of 96% ethanol extract of lemongrass (Cymbopogon citratus) UPLC-QToF MS/MS method against the HMG CoA Reductase (1HW9) receptor. These compounds were analyzed for physicochemical properties with SwissADME and toxicity using Protox Online Tools. 19 compounds obtained from metabolite profiling met the rules of good physicochemical properties and were non-toxic. The selected compounds were then prepared using ChemDraw Ultra, then optimized geometry with Avogadro. Then molecular docking was performed with PyRx. Visualization of Molecular docking results was carried out with Biovia Discovery Studio to look for antagonistic interactions with Simvastatin native ligands. The tethering is said to be valid and the software can be used if the RMSD value is < 2Å. naturally to 1HW9 protein showed the presence of three compounds that provide antagonistic interactions with affinity bond values, acophores distance, and type of amino acid analysis. Butylated hydroxytoluene, Hexylresorcinol, and Bis[4-(diethylamino)phenyl] methanone compounds are compounds that are predicted to have the best potential as anticholesterolemia because they have docking parameters with the Native Ligand Simvastatin. Therefore, the 96% ethanol extract of lemongrass (Cymbopogon citratus) was predicted to have anticholesterolemic activity by inhibiting the activation of the HMG CoA Reductase receptor.

ARABIC:

يعتبر الكوليسترول عنصرًا مهمًا في الجسم في تنظيم العملية الكيميائية ولكن مستويات الكوليسترول الزائدة تسبب إلى ارتفاع نسبة الكولسترول في الدم. وأحد الأدوية المستخدمة في علاج فرط كوليسترول الدم هو مضاد الكوليسترول. إن استخدام مضاد الكوليسترول في الدم على المدة الطويلة له آثر جانبي، فلذلك من الابتكار في البحث لا بد البحث عن أدوية بديلة باستخدام النباتات الطبية. ومن النباتات الطبية التي يستطيع أن تكون كالمضاد هي عشب الليمون (Cymbopogon citratus). وكان الهدف من هذا البحث هي لتنبؤ نشاط مركبات مضاد الكوليسترول في التنميط الأيضي لمستخلص الإيثانول بنسبة 96٪ من عشب الليمون (Cymbopogon citratus) بطريقة UPLC-QToF MS/MS على مستقبل الاختزال (1HW9). وتم تحليل هذه المركبات عن الخصائص الفيزيائية والكيميائية ب SwissADME والسمية باستخدام أدوات بروتوكس عبر الإنترنت. وحصلت على 19 مركبًا من التنميط الأيضي وفقًا لقواعد الخصائص الفيزيائية والكيميائية الجيدة ولم تكن سامة. وبعد ذلك يستعد المركب المحدد باستخدام ChemDraw Ultra، ثم الهندسة المحسنة باستخدام Avogadro. ثم أجرأ الالتحام الجزيئي باستخدام PyRx.وتصور الالتحام الجزيئي باستخدام Biovia Discovery Studio للبحث عن تفاعلات معادية على رابط سيمفاستين الأصلية. ويحقق الحبل صالح إذا كانت قيمة RMSD <2Å. وأظهر التحليل بالشكل في السيليكو لبروتين 1HW9 أن هناك ثلاثة مركبات أعطت تفاعلات معادية بقيم تقارب الارتباط ومسافة فارماكوفور وأنواع ربط الأحماض الأمينية. ومركبات بوتيليتيد هيدروكسيتولوين وهيكسيل ريزورسينول، وبيس [4- (ثنائي إيثيل أمينو) فينيل] ميتانون هي أفضل إمكانات كمضاد الكوليسترول لأنها تحتوي على المماثلة بين المعيار الإرسائي ورابط سيمفاستين الأصلية. فلذلك، قد توقع أن يكون لمستخلص الإيثانول بنسبة 96٪ من عشب الليمون (Cymbopogon citratus) لديه نشاط المضاد للكوليسترول بعملية منع تنشيط مستقبل HMG CoA المختزلة.