Prediksi senyawa fitoestrogen yang berpotensi antiosteoporosis pada ekstrak etanol 96% daun chrysophyllum cainito l. terhadap estrogen receptor α (1a52) dan β (3ols) secara in silico

ABSTRAK:

Osteoporosis adalah kondisi dimana berkurangnya massa tulang yang nyata dan dapat berakibat menjadi semakin rendahnya kepadatan pada tulang. Hal ini bisa terjadi
karena kondisi kekurangan estrogen yang dialami oleh wanita pascamenopause. Salah satu terapi untuk mengatasi penyakit ini adalah menggunakan senyawa fitoestrogen. Senyawa fitoestogen merupakan senyawa yang memiliki sifat dan khasiat yang mirip dengan hormon estrogen. Salah satu tumbuhan yang diketahui mengandung fitoestrogen adalah C. cainito.Kandungan senyawa fitoestrogen dalam tanaman C. cainito dapat diprediksi dengan uji in silico. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi jenis kandungan senyawa fitoestrogen yang berpotensi sebagai antiosteoporosis dari hasil metabolite profiling ekstrak etanol 96%
daun C. cainito secara in silico terhadap ERα dengan ID protein 1A52 dan ERβ dengan ID protein 3OLS. Senyawa hasil metabolite profiling ekstrak etanol 96% daun C. cainitodigambar menggunakan software ChemDraw Ultra 12.0 dan dioptimasi menggunakan software Avogadro 1.0.1 untuk mendapatkan struktur 3D paling stabil. Protein X-ray 1A52
dan 3OLS dari PDB RCSB dipisahkan dari ligand internal, yaitu 17β-estradiol. Berikutnya dilakukan molecular docking pada masing-masing senyawa terhadap kedua protein
menggunakan software PyRx 0.8 dengan metode AutoDock Vina. Hasil yang didapat divisualisasikan menggunakan software Biovia Discovery Visualizer 2016 untuk mencari
interaksi agonis yang terjadi, dimana interaksi agonis menunjukkan kemiripan parameter dengan ligan internal yaitu 17β-estradiol. Senyawa yang memiliki interaksi agonis kemudian dianalisis sifat fisikokimia untuk melihat senyawa dapat diterima oleh tubuh.Hasil penelitian menunjukkan terdapat 6 senyawa yang memiliki interaksi agonis terhadap protein 1A52 dan 7 senyawa yang memiliki interaksi agonis terhadap protein 3OLS. Semua
senyawa ini diprediksi memiliki parameter yang sangat mirip dengan 17β-estradiol dan dapat diterima oleh tubuh sebagai terapi antiosteoporosis.

ABSTRACT:

Osteoporosis is a condition where there is a marked reduction in bone mass and can result in lower bone density. It occurs because of the condition of estrogen deficiency experienced by postmenopausal women. One of the therapy to treat this disease is phytoestrogen compounds. Phytoestrogen compounds are compounds that have properties and merits similar to the hormone estrogen. One of the plants known to contain phytoestrogens is C. cainito. In silico test was used to predict the phytoestrogen compounds in this plant. This study aims to predict the type of phytoestrogen coterapimpounds that have the potential for anti-osteoporosis from the metabolite profiling of 96% ethanol extract of C. cainito leaves in silico against ERα with protein ID 1A52 and ERβ with protein ID 3OLS. Compounds resulting from its metabolite profiling were drawn using ChemDraw Ultra 12.0 software and optimized using Avogadro 1.0.1 software to obtain the most stable 3D structure. X-ray proteins 1A52 and 3OLS of PDB RCSB were separated from the internal ligand, namely 17β-estradiol. Next, molecular docking was performed on each compound against the two proteins using PyRx 0.8 software using the AutoDock Vina method. Then, Biovia Discovery Visualizer 2016 was used to look for occurred agonist interactions, where agonist interactions showed similar parameters to the internal ligand, namely 17β-estradiol. Agonist interaction compounds are then analyzed for physicochemical properties to see which one can be accepted by the body. The results showed that six compounds had agonist interactions with 1A52 protein and seven compounds with 3OLS proteins. These compounds have been predicted to have similar parameters to 17β-estradiol and can be accepted by the body as anti-osteoporosis therapy.

مستخلص البحث:

هشاشة العظام هي حالة يحدث فيها انخفاض ملحوظ في كتلة العظام ويمكن أن تؤدي إلى انخفاض كثافة العظام. قد يحدث هذا لدى النساء بعد الطمث بسبب نقص الاستروجين. و من الأدوية لهذا المرض هو مركبات فيتويستروجين. هذه المركبات لها خصائص مشابهة بهرمون الاستروجين. ومن النباتات المتوقعة إذ تحتوى على فيتويستروغنز هو C. cainito ذلك عن طريق الاختبار حاسوبيا. يهدف هذا البحث إلى التوقع أن نوع مركبات فيتويستروجين قادرة على أن تكون مضادة لهشاشة العظام الناتجة من تشخيص المستقلب لاستخراج الإيثانول 96٪ من أوراق C. cainito في السيليكو ضد ERα بـ ID بروتين A521 و ERβ بـ ID بروتين OLS3. يتم الرسم لمركب التنميط المستقلب لاستخراج الإيثانول 96٪ من أوراق C. cainito باستخدام برنامجChemDraw Ultra 12.0 ويكون الرسم الأمثل باستخدام برنامج Avogadro 1.0.1 للحصول على البنية ثلاثية الأبعاد الأكثر استقرارا. يتم فصل بروتينات الأشعة السينيةA52 1 و OLS3 من بنك معلومات البروتين RCSB PDB من الليغند الداخلي، وهو β17-استراديول. وبالتالي يتم التجزئة الجزيئي لكل مركب على البروتينين الاثنتين باستخدام برنامج PyRx 0.8 بطريقة AutoDock Vina. ثم تعرض صور النتائج عن طريق برنامج Biovia Discovery Visualizer 2016 للبحث عن التفاعلات الناضجة التي تحدث، حيث يظهر التفاعل الناهض على معيار مماثل مع الليغند الداخلي أي β-estradiol17. ثم يتم تحليل المركبات التي لها تفاعلات ناضجة للخصائص الفيزيائية الكيميائية لمعرفة أن المركبات مقبولة لدى الجسم. والحاصل أن 6 مركبات لها تفاعلات ناضجة على البروتين 1A52 و 7 مركبات لها تفاعلات ناضجة على بروتينات 3OLS. ويتوقع أن كل هذه المركبات لها معيار مشابه بكثير بـ 17β استراديول ومقبول للجسم كعلاج مضادة لهشاشة العظام.