Keragaman genetik tumbuhan Kosambi (Schleichera oleosa) berdasar penanda molekuler ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) di wilayah Malang Raya

INDONESIA:

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keanekaragaman gen pada tumbuhan S. oleosa. pada wilayah Malang Raya dengan menggunakan penanda ISSR, pengaruh keadaan lingkungan terhadap keaneka ragaman gen pada tumbuhan S. oleosa. pada wilayah Kota Malang dan Malang Kabupaten, Serta mengetahui primer ISSR yang mampu menganalisis tumbuhan ini dengan baik. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif eksploratif kuantitatif. Rangkaian penelitian ini antara lain adalah eksplorasi dan isolasi DNA S. oleosa. Analisis menggunakan metode PCR dengan primer 6 ISSR. Serta pengamatan abiotik tiap lingkungan aksesi berupa pH, kelembapan udara dan tanah, intensitas cahaya, intensitas cahaya tanah, dan suhu. Eksplorasi dilakukan di wilayah Malang Raya guna mencari tanaman S. oleosa. Hasil data molekuler kemudian diolah hingga didapatkan dendogram dengan program PAST.362 untuk mengetahui pengelompokan tiap aksesi. Diketahui tiap primer mampu mengamplifikasi band-band polimorfik. Hasil analisis performa kekuatan primer menunjukkan primer berkode A adalah yang paling baik. Setelah didapatkan similaritas dan dendogram tiap aksesi terbentuk 4 klaster. Faktor abiotik yang cukup representatif dalam menunjukkan pengelompokan tersebut adalah pH tanah. Hasil tersebut menunjukkan terdapat keragaman gen S. oleosa di wilayah Malang Raya dan terkait dengan faktor abiotik lingkungannya.

ENGLISH:

This study aims to determine the diversity of genes in S. oleosa plants. in the Greater Malang area using ISSR markers, the effect of environmental conditions on the diversity of genes in S. oleosa plants. in the areas of Malang City and Malang Regency, as well as knowing the ISSR primer which can analyze this plant well. This research uses a descriptive quantitative exploratory method. The series of research included exploration and isolation of S. oleose DNA. The analysis used the PCR method with 6 ISSR primers. As well as abiotic observations of each accession environment in the form of pH, air and soil humidity, light intensity, soil light intensity, and temperature. Exploration was carried out in the Greater Malang area in search of S. oleosa plants. The results of the molecular data were then processed to obtain a dendrogram with the PAST.362 program to determine the grouping of each accession. It is known that each primer can amplify polymorphic bands. The results of the primary strength performance analysis showed that the primer coded A was the best. After obtaining similarity and dendrogram for each accession, 4 clusters were formed. The abiotic factor which is quite representative in showing the grouping is soil pH. These results indicate that there is a diversity of S. oleosa genes in the Greater Malang region and it is related to the abiotic factors of the environment.

ARABIC:

يهدف هذا البحث إلى معرفة أنواع جينات في نبات S. oleosa. في نطاق مالانج الكبرى باستخدام علامة ISSR. تأثير أحوال البيئة نحى أنواع جينات في نبات S. oleosa. في نطاق مدينة مالانح ومحافظة مالانج. وكذلك معرفة ISSR التمهيدي القادر على تحليل هذا النبات جيدا. يستخدم هذا البحث المنهج الوصفي الاستكشافي الكمي. تضمنت سلسلة هذا البحث ألا وهي الاستطلاع و عزل الحمض النووي S. oleosa. استخدم التحليل طريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل مع ست بادئات ISSR. بالإضافة إلى الملاحظات اللأحيائية لكل بيئة مدخل على شكل درجة الحموضة، ورطوبة الهواء والتربة، وشدة الضوء، وشدة ضوء التربة، ودرجة الحرارة. تم إجراء التنقيب في منطقة مالانج الكبرى بحثا عن نباتات S. oleosa. تمت معالجة نتائج البيانات الجزئية بعد ذلك للحصول على مخطط الأسنان باستخدام برنامج PAST.362 لمعرفة تقسيم الفرق. من المعروف أن كل جهاز تمهيدي قادر على تضخيم النطاقات متعددة الأشكال. أظهرت نتائج تحليل أداء القوة الأولية أن التمهيدي المشفر A كان الأفضل. بعد الحصول على التشابه و dendogram لكل سلالة، تم تشكيل 4 مجموعات. العامل الأحيائية الذي يمثل تماما في إظهار المجموعة هو الرقم الهيدورجيني للتربة، تشير هذه النتائج إلى وجود تنوع في جينات S. oleosa. في منظقة مالانج الكبرى وهي متربطة بالعوامل الأحيائية للبيئة