Hubungan kekerabatan serta pengelompokan kultivar pisang berdasarkan marka morfologi dan sekuen intron trnl

مستخلص البحث

يذكر سيموندز أن أصناف الموز في جنوب شرق آسيا تأتي من نسل Musa acuminata و Musa balbisiana. يتم استخدام كل من الموز كعلامة للأسماء الجينومية حيث تساهم كل موزة في الجينوم A و B. ومع ذلك ، فإن استخدام هذا النظام غير موضوعي ، لذلك هناك حاجة إلى نهج جزيئي من خلال تسلسل الحمض النووي إنترون الخاص بالإنترون والذي يمكن أن يقال أنه أكثر دقة لأنه يمكن أن يقرأ التغييرات في قواعد النوكليوتيدات التي يمكن استخدامها لتحليل معدل التطور. كان الغرض من هذه الدراسة هو تحديد تطور أصناف الموز في شكل الأشجار الوراثية. ومن المتوقع أن تكون نتائج هذه الدراسة مرجعا في تربية الموز في وقت لاحق. استخدمت هذه الدراس14 من أصناف الموز ، تتكون من الجينوم AA و AAA و AAB و ABB و BB.

أنتجت الأبحاث المستندة إلى المورفولوجيا مع 33 حرفًا 5 عمالقة باستخدام تطبيق PAST باستخدام مؤشر تشابه Bray-curtis. أن نتائج البحث المستندة إلى علامات جزيئية إنترون trnL وهي تسلسلات إنترون trnL قادرة على تتبع الأحرف الجينومية المشتقة من خلال تحليل نتائج التسلسل مع نتائج التسلسل في شكل بدائل مختلفة ونتائج انفجار من تسلسل 13 صنف من الموز. نتائج تحليل البيانات التطورية ، بدأ في تطور أصناف الموز في 51.9 ميا تتراوح ما بين 44.8 ميا إلى 60.5 ميا التي حدثت في أوائل العصر الأيوسيني. حدثت ذروة تنوع صنف الموز في 16 ميا تراوحت ما بين 29.8 ميا و 5 ميا في عصر الميوسين.

ABSTRACT

Simmonds stated that banana cultivars in Southeast Asia come from Musa acuminata and Musa balbisiana generation. Those banana becomes a reference for genome names which are every banana gives A and B genome. All the time, the morfological indentification is used to find out the banana genome nomenclature. However, the use of the morphology identification is subjective. To create the result more accurate, it needs the molecular approachment through trnL intorn specific DNA sequences because it is used to read the nucletide base change that can be used to analyze the evolution rate. The study aims to find out the banana cultivar evolution in the form of phylogenic trees. As the result of the study, the researcher hopes that this study can be used as a reference in banana breeding in the further study. This study uses 14 (fourteen) banana cultivar, it consists of AA, AAA, AAB, ABB and BB genome.

The study is based on morphology marker with 14 characters that produce 5 clusters by using PAST application and Bray-curtis similarity index. While the result of trnL intron molecular marker shows that trnL intron sequence can find the generation of genome characters through analysis of sequencing results by the data of sequencing results in the various substitutions and the BLAST results from 13 banana cultivar sequences. Furthermore, the result of evolution data analysis began in 51.9 Mya ranging from 44.8 Mya to 60.5 Mya in the early Eocene era. The highest of banana cultivar diversification occurred in 16 Mya ranging from 29.8 Mya to 5 Mya in the Miocene era.

ABSTRAK

Simmonds menyatakan bahwa kultivar pisang di Asia Tenggara berasal dari keturunan Musa acuminata dan Musa balbisiana. Kedua pisang tersebut dijadikan penunjuk nama genom dimana masing-masing pisang menyumbang genom A dan B. Selama ini, untuk mengetahui tata nama genom kultivar pisang dilakukan melalui identifikasi morfologi. Namun, penggunaan sistem ini bersifat subyektif, oleh karena itu diperlukan pendekatan molekuler melalui sekuen DNA spesifik intron trnL dapat dikatakan lebih akurat karena dapat membaca perubahan basa nukleotida yang dapat digunakan untuk menganalisis laju evolusi. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui evolusi dari kultivar pisang dalam bentuk pohon filogenetik. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi acuan dalam pemuliaan pisang nantinya. Penelitian ini menggunakan 14 kultivar pisang, terdiri dari genom AA, AAA, AAB, ABB dan BB.

Penelitian berdasarkan maka morfologi dengan 33 karakter mengasilkan 5 culster menggunakan aplikasi PAST menggunakan indeks similaritas Bray-curtis. Sedangkan hasil penelitian berdasarkan marka molekuler intron trnL yakni sekuen intron trnL mampu menulusuri karakter genom yang diturunkan melalui analisis hasil sekuensing dengan data hasil sekuensing berupa macam-macam subtitusi dan hasil BLAST dari 13 sekuen kultivar pisang tersebut. Hasil analisis data evolusi, evolusi kultivar pisang dimulai pada 51.9 Mya berkisar antara 44.8 Mya hingga 60.5 Mya yang terjadi pada zaman Eocene awal. Puncak diversifikasi kultivar pisang terjadi pada tahun 16 Mya berkisar antara 29.8 Mya hingga 5 Mya terjadi pada zaman Miocene.