Kumala, Ridlo Rimba (2020) Studi In Silico senyawa antikanker pada ekstrak etanol 96% daun Chrysanthemum cinerariifolium terhadap reseptor Vascular Endothelial Growth Factor (3WZD). Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
|
Text (Fulltext)
16670020.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (9MB) | Preview |
Abstract
مستخلص البحث
الأقحوان الدلماسية هي إحدى النباتات التي لديها إمكانية لمضادة السرطان لأنها تحتوي على محتوى مركب فلافونويد و تربينويد. غالبًا ما يرتبط نمو السرطان بالتعبير المفرط لمستقبلة عامل النمو الانهوفي الوعائي (VEGFR) كمسار بروفاوي لزيادة مستوى تولد الأوعية. يهدف هذا البحث إلى تحديد نشاط مضادة السرطان، وسمية المركبات والتنبؤ بالخصائص الفيزيائية الكيميائية للمركبات الواردة في مستخرجة الإيثانول ٩٦% من ورقة الأقحوان الدلماسية. المركبات الناتجة من مستقلبة تنميط UPLC QtoF MS/MS قامت به أيو (2018) في مستخرجة الإيثانول ٩٦% من ورقة الأقحوان الدلماسية، تم فحصها باستخدام SwissADME مع معلمات عدم اختراق حاجز الدم في الدماغ، P-gp non substrat، والاستيفاء بالقاعدة الخمسة ليبينسكي. أنتجت عشرة مركبات تجتاز عملية الفحص، ثم أجري الإختناق الجزيئي في مستقبلة عامل النمو البطاني الوعائي (3WZD) باستخدام Molegro Virtual Docker (MVD)وتعتبر صالحة إذا كانت لديها قيمة RMSD < 2Å. مركب azoxystrobin لها نشاط أفضل من المركبات الأخرى لأنها تملك أدنى معدل. فمعدل azoxystrobin هو -٨٥.٦٩٧٧ ككال/مول. في حين أن التنبؤ بالسمية باستخدام تطبيقات protox II online tool و pkCSM online tool. تكون فئة سمية عشرة مركبات بين خمس وثلاثين مركبًا الناتج من مستقلبة تنميط UPLC QtoF M/MS قامت به أيو (٢٠١٨) في مستخرجة الإيثانول ٩٦% من ورقة الأقحوان الدلماسية وفقا للنظام العالمي وقيمة LD50 هي في الفئة 3 (تسم إذا ابتلعت أي 50 < LD50 ≤ 300 ملغ/كغ)، الفئة ٤ (تضر إذا ابتلعت أي 300 <LD50 ≤ 2000 ملغ/كغ) والفئة ٥ (قد تضر إذا ابتلعت أي 2000 <LD50 ≤ 5000 ملغ/كغ).
ABSTRACT
Chrysanthemum cinerariifolium is a plant that has potential as an anticancer because it contains flavonoid compounds and terpenoids. Cancer growth is often associated with excessive expression of Vascular Endothelial Growth Factor receptor (VEGF) as a proangiogenic pathway to increase the stage of angiogenesis. This study aims to determine anticancer activity, compound toxicity and predictions of physicochemical properties of compounds contained in 96% ethanol extract of Chrysanthemum cinerariifolium leaves. The compound produced by UPLC QtoF MS / MS metabolite profilling by Ayu (2018) in 96% ethanol extract of Chrysanthemum cinerariifolium leaves was screened using SwissADME with parameters not penetrating the blood brain barrier, P-gp non-substrate, and complying with the Five Lipinski Laws. There are 10 compounds that pass screening then do molecular docking to VEGF receptors (3WZD) using Molegro Virtual Docker (MVD). VEGF receptors (3WZD) are declared valid because they have an RMSD <2Å. Azoxystrobin compound has a better activity than other compounds because it has the lowest rerank score. Rerank score of azoxystrobin is -85.6977 Kcal / mol. Whereas the prediction of toxicity uses the protox II online tool and the pkCSM online tool. The toxicity class of 10 compounds among 35 compounds produced by UPLC QtoF MS / MS metabolite profilling by Ayu (2018) in 96% ethanol extract of Chrysanthemum cinerariifolium leaves based on GHS and LD50 values were class 3 (toxic if ingested i.e 50 <LD50 ≤ 300 mg / kg ), class 4 (dangerous if swallowed i.e. 300 <LD50 ≤ 2000 mg / kg) and class 5 (possibly dangerous if swallowed i.e. 2000 <LD50 ≤ 5000 mg / kg).
ABSTRAK
Chrysanthemum cinerariifolium merupakan salah satu tumbuhan yang memiliki potensi sebagai antikanker karena memiliki kandungan senyawa flavonoid dan terpenoid. Pertumbuhan kanker sering dikaitkan dengan ekspresi berlebihan reseptor Vascular endothelial growth factor (VEGF) sebagai jalur proangiogenik untuk meningkatkan tahap angiogenesis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktivitas antikanker, toksisitas senyawa dan prediksi sifat fisikokimia senyawa yang terkandung dalam ekstrak etanol 96% daun Chrysanthemum cinerariifolium. Senyawa hasil metabolite profilling UPLC QtoF MS/MS oleh Ayu (2018) dalam ekstrak etanol 96% daun Chrysanthemum cinerariifolium dilakukan skrining menggunakan SwissADME dengan parameter tidak menembus sawar darah otak, P-gp non substrat, dan memenuhi Hukum Lima Lipinski. Terdapat 10 senyawa yang lulus skrining kemudian dilakukan penambatan molekuler terhadap reseptor VEGF (3WZD) menggunakan Molegro Virtual Docker (MVD). Reseptor VEGF (3WZD) dinyatakan valid karena memiliki RMSD < 2Å. Senyawa azoxystrobin memiliki aktivitas lebih baik dibanding senyawa yang lain karena memiliki rerank score yang paling rendah. Rerank score azoxystrobin ialah -85.6977 Kkal/mol. Sedangkan prediksi toksisitas menggunakan aplikasi protox II online tool dan pkCSM online tool. Kelas toksisitas dari 10 senyawa diantara 35 senyawa hasil metabolit profilling UPLC QtoF MS/MS oleh Ayu (2018) dalam ekstrak etanol 96% daun Chrysanthemum cinerariifolium berdasarkan GHS dan nilai LD50 yaitu kelas 3 (toksik jika tertelan yaitu 50 <LD50 ≤ 300 mg / kg), kelas 4 (berbahaya jika tertelan yaitu 300 <LD50 ≤ 2000 mg / kg) dan kelas 5 (kemungkinan berbahaya jika tertelan yaitu 2000 <LD50 ≤ 5000 mg / kg).
Item Type: | Thesis (Undergraduate) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Supervisor: | Muti’ah, Roihatul and Indrawijaya, Yen Yen Ari | |||||||||
Contributors: |
|
|||||||||
Keywords: | في السيليكو; الأقحوان الدلماسية; عامل النمو الانهوفي الوعائ; (VEGFR) ;مضادة السرطان.; In silico; Chrysanthemum cinerariifolium; VEGF; Anticancer; In silico; Chrysanthemum cinerariifolium; VEGF; Antikanker | |||||||||
Subjects: | 08 INFORMATION AND COMPUTING SCIENCES > 0801 Artificial Intelligence and Image Processing > 080110 Simulation and Modelling 11 MEDICAL AND HEALTH SCIENCES > 1101 Medical Biochemistry and Metabolomics > 110106 Medical Biochemistry - Proteins and Peptides (incl. Medical Proteomics) 11 MEDICAL AND HEALTH SCIENCES > 1115 Pharmacology and Pharmaceutical Sciences > 111504 Pharmaceutical Sciences |
|||||||||
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Farmasi | |||||||||
Depositing User: | Ridlo Rimba Kumala | |||||||||
Date Deposited: | 31 Aug 2020 11:27 | |||||||||
Last Modified: | 31 Aug 2020 11:27 | |||||||||
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/20699 |
Downloads
Downloads per month over past year
Actions (login required)
View Item |