Damaiyanti, Jamilah (2020) Studi In Silico Senyawa Heliannuols A, B , C, D, E pada tanaman Bunga Matahari (Helianthus Annuus L)Terhadapenzimdual Pi3k/mTor(5OQ4). Undergraduate thesis, Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim.
|
Text (Fulltext)
16670018.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (2MB) | Preview |
Abstract
مستخلص البحث
دامانيانتي، جميلة، ٢٠٢٠، دراسة في السيليكو لمركب هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ من نبات دوار الشمس (Helianthus annuus L ) على إنزيم مزدوج فوسفوينوسيفايد ٣ كيناز (PI3Ks) / Mtor (5OQ4). البحث الجامعي، قسم الصيدلة، كلية الطب والعلوم الصحية بجامعة مولانا مالك إبراهيم الإسلامية الحكومية مالانج. المشرف الأول: د. رائحة المطيعة، الماجستيرة. المشرف الثاني: ين ين أري، الماجستيرة. المختبر: تانايا، الماجستيرة.
تنتمي هيليانيول إلى مجموعة السيسكويتربين (sesquiterpen) التي لديها حلقة البنزوكسيبين (benzoxepine)، أوكسيبين (oxepin). يظهر كل مشتقات من مركب البنزوكسيبين نشاطا لمضادة السرطان عن طريق تثبيط فوسفوينوسيفايد ٣ كيناز (PI3Ks). تم انتشار ونمو الخلايا و أيضا حياة الأورام من قبل أحد المسارات التي هي مسار الإشارة فوسفوينوسيفايد ٣ كيناز (PI3Ks). يهدف هذا البحث إلى التنبؤ بالخصائص الفيزيائية الكيميائية مع القاعدة الخمسة ليبينسكي، نشاط إنزيم على فوسفوينوسيفايد ٣ كيناز (PI3K; PDB 5OQ4) و سمية مركب هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ. أجري التنبؤ بالخصائص الفيزيائية الكيميائية بالقاعدة الخمسة ليبينسكي باستخدام أداة التنبؤ الرقمية بخصائص الجزيئات الدوائية والسمية الصغيرة بالرسم البياني (pkCSM). يتم التحقق من صحة مستقبلة 5OQ4 مع قيمة RMSD › 2 (Å). واستخدمت أداة رقمية Protox و pkCSM للتنبؤ السمية مع قاعدة LD50، وحساسية الجلد، سمية أميس، تسمم الكبد وفئة السمية. التفاعل بين ربيطة (ligand) وإنزيم باستخدام تطبيقات Molegro Virtual Docker 6.0 أشارات إلى استفاء مركب هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ ي بالقاعدة الخمسة ليبينسكي. واعتبرت مستقبلة 5OQ4 صالحة بقيمة RMSD : 0,923 (Å). يثبط مركب هيليانيول أ، ب، ج، د، هـ إنزيم مزدوج فوسفوينوسيفايد ٣ كيناز (PI3Ks) / Mtor (5OQ4) PI3K/mTOR أقل من Bimiralisib مع درجة المتوسطة: -٩٩.٦٨٥ (Kkal/mol). وينتمي مركب هيليانيول أ، ب، ج، هـ ومركب Bimiralisib إلى الفيئة الرابعة، وأما مركب هيليانيول د فهو ينتمي إلى الفيئة الخامسة في السيليكو.
ABSTRACT
Heliannuol is a sesquiterpene which has benzoxepine ring, oxepin. Many derivatives of benzoxepine compound show anticancer activity by inhibiting phosphoinositide 3-kinase (PI3K) enzyme. Proliferation and cell growth and tumor life are contributed by one signal line of phosphoinositide 3-kinase (PI3K). The study aims to predict the physicochemical properties using Lipinski’s Rule of Five parameter on phosphoinositide 3- kinase (PI3K; PDB 5OQ4) enzyme and the toxicity of Heliannuol A, B, C, D, E compounds. The process uses pkCSM online tool. The validation of receptor 5OQ4 is done using value parameter RMSD < 2 (Å). Protox online tool dan pkCSM online tool are employed to predict the toxicity using parameter LD50, skin sensitization, Ames toxicity, hepatotoxicity and toxicity class. The interaction of ligan and enzyme is tested using Molegro Virtual Docker 6.0. Heliannoul A, B, C, D, E compounds fulfill Lipinski’s Rule of Five. The receptor 5OQ4 is known valid using the value of RMSD 0,923 (Å). Heliannuol A, B , C, D, E compounds inhibit Dual PI3K / mTOR enzyme less than Bimiralisib with Rerank score of Bimiralisib -99,685 (Kkal/mol). The compound of Helliannoul A, B, C, E and Bimiralisib are included in class 4. Meanwhile, the compound of Helliannoul D are included in class 5 in silico.
ABSTRAK
Heliannuols termasuk dalam golongan sesquiterpen yang memiliki cincin benzoxepine, oxepin. Berbagai turunan senyawa benzoxepine menunjukkan aktivitas antikanker dengan menghambat enzim phosphoinositida 3- kinase (PI3K). Proliferasi dan pertumbuhan sel serta kelangsungan hidup tumor diperankan oleh salah satu jalur yaitu jalur persinyalan phosphoinositida 3- kinase (PI3K). Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi sifat fisikokimia dengan parameter hukum lima lipinski, aktifitas terhadap enzim phosphoinositida 3- kinase (PI3K; PDB 5OQ4) serta toksisitas dari senyawa Heliannuols A, B, C, D, E. Prediksi sifat fisikokimia dengan parameter hukum lima lipinski dilakukan dengan menggunakan pkCSM online tool. Validasi reseptor 5OQ4 dilakukan dengan parameter nilai RMSD < 2 (Å). Protox online tool dan pkCSM online tool digunakan untuk meprediksikan toksisitas dengan parameter LD50, skin sensitization, ames toxicity, hepatotoxycity dan kelas toksisitas. Interaksi ligan dan enzim menggunakan Molegro Virtual Docker 6.0. Senyawa Heliannouls A, B, C, D, E memenuhi hukum lima lipinski. Reseptor 5OQ4 dinyatakan valid dengan nilai RMSD 0,923 (Å). Senyawa Heliannuols A, B , C, D, E menghambat enzim Dual PI3K / mTOR tidak lebih besar dari pada Bimiralisib dengan rerank score Bimiralisib -99,685 (Kkal/mol) dan senyawa Helliannouls A, B, C, E serta senyawa Bimiralisib masuk dalam kelas 4 sedangkan senyawa Helliannouls D masuk dalam kelas 5 secara in silico.
Item Type: | Thesis (Undergraduate) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Supervisor: | Muti’ah, Roihatul and Indrawijaya, Yen Yen Ari | |||||||||
Contributors: |
|
|||||||||
Keywords: | in-silico; Heliannuols; PI3K/Mtor; glioblastoma; in-silico; Heliannuols; PI3K/Mtor; glioblastoma | |||||||||
Subjects: | 08 INFORMATION AND COMPUTING SCIENCES > 0801 Artificial Intelligence and Image Processing > 080110 Simulation and Modelling | |||||||||
Departement: | Fakultas Sains dan Teknologi > Jurusan Farmasi | |||||||||
Depositing User: | Jamilah Damaiyanti | |||||||||
Date Deposited: | 27 Aug 2020 13:30 | |||||||||
Last Modified: | 27 Aug 2020 13:30 | |||||||||
URI: | http://etheses.uin-malang.ac.id/id/eprint/19705 |
Downloads
Downloads per month over past year
Actions (login required)
View Item |